More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0465 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0465  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0491  LysR family transcriptional regulator  98.37 
 
 		 306 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2614  LysR family transcriptional regulator  98.37 
 
 		 306 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00915901  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3581  LysR family transcriptional regulator  96.41 
 
 		 306 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1471  LysR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3853  LysR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0876219  normal  0.133098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1861  LysR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1436  LysR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.634744  normal  0.320614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15310  transcriptional regulatory protein, LysR family  47.73 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.313751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2307  putative transcriptional regulator  47.1 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3995  LysR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000135296  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27250  LysR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 339 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2131  LysR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0617506  normal  0.31287 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  41.16 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3767  LysR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 311 aa  199  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2579  transcriptional regulator, LysR family  39.63 
 
 		 311 aa  195  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1271  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 324 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658069  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  39.87 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 304 aa  188  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2831  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2813  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2956  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1545  transcriptional regulator, LysR family  34.94 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.813324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4093  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6347  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.264946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1482  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7013  LysR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1305  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1327  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.893209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0050  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.142799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 328 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4537  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1094  LysR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.75 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1372  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0864691 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1394  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0912  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.990881  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 304 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5829  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5143  transcriptional regulator, LysR family  43.24 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0824  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  37.41 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5612  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 301 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0432905  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 304 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  37.92 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  41.82 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  38.06 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 307 aa  175  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 294 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4923  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.93 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3064  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  35.12 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3206  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 305 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 295 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  40.54 
 
 		 310 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 310 aa  172  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  37.92 
 
 		 298 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4511  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03790  Transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3081  transcriptional regulator, LysR family  40.15 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666211  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37120  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0187077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3963  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 324 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3456  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 340 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.695325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1493  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2531  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0797  LysR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.433602  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>