More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0354 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
131 aa  262  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
131 aa  262  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
131 aa  262  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
131 aa  262  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
131 aa  262  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
131 aa  262  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  99.24 
 
 
131 aa  261  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  98.47 
 
 
131 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  98.47 
 
 
131 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  98.47 
 
 
131 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  98.47 
 
 
131 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  98.47 
 
 
131 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  98.47 
 
 
131 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  98.47 
 
 
131 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  98.47 
 
 
131 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  98.32 
 
 
131 aa  235  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  96.64 
 
 
130 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  96.64 
 
 
130 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  84.5 
 
 
129 aa  216  7e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  82.31 
 
 
132 aa  216  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  84.3 
 
 
131 aa  210  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5044  50S ribosomal protein L17  82.64 
 
 
132 aa  209  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0346  50S ribosomal protein L17  76.92 
 
 
132 aa  209  9e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.962629  unclonable  0.0000000436647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  85.71 
 
 
132 aa  208  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  83.47 
 
 
131 aa  206  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  77.69 
 
 
131 aa  206  8e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  84.03 
 
 
132 aa  205  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  79.69 
 
 
129 aa  206  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  75.76 
 
 
132 aa  205  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  79.69 
 
 
129 aa  206  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  86.55 
 
 
131 aa  205  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  77.1 
 
 
132 aa  205  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2300  ribosomal protein L17  79.37 
 
 
133 aa  204  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  78.86 
 
 
133 aa  203  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  82.5 
 
 
132 aa  202  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0627  50S ribosomal protein L17P  73.28 
 
 
134 aa  201  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3922  ribosomal protein L17  75.97 
 
 
132 aa  201  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  80.51 
 
 
131 aa  196  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  74.81 
 
 
131 aa  196  9e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  75.41 
 
 
129 aa  193  8.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  80.17 
 
 
130 aa  193  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  69.47 
 
 
130 aa  184  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  69.47 
 
 
130 aa  184  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  69.47 
 
 
130 aa  183  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 
127 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  67.94 
 
 
130 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  69.05 
 
 
128 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  70.4 
 
 
126 aa  180  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  70.73 
 
 
127 aa  180  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  73.11 
 
 
132 aa  179  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 
127 aa  179  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 
127 aa  179  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 
127 aa  179  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 
127 aa  179  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 
127 aa  179  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 
127 aa  179  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  70.16 
 
 
127 aa  179  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  71.67 
 
 
129 aa  179  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 
127 aa  179  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 
127 aa  179  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  71.67 
 
 
128 aa  179  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 
127 aa  179  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  70.16 
 
 
127 aa  179  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  69.35 
 
 
127 aa  179  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 
127 aa  179  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 
127 aa  179  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 
127 aa  179  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  69.6 
 
 
125 aa  179  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  69.67 
 
 
126 aa  177  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  69.35 
 
 
126 aa  177  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  64.89 
 
 
132 aa  176  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  71.19 
 
 
129 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  71.19 
 
 
129 aa  175  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  71.19 
 
 
129 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  67.48 
 
 
128 aa  175  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3498  ribosomal protein L17  67.2 
 
 
126 aa  174  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110108  hitchhiker  0.0000306031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06510  50S ribosomal protein L17  67.94 
 
 
130 aa  174  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2615  ribosomal protein L17  67.2 
 
 
126 aa  174  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718134  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  68.25 
 
 
126 aa  174  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0863  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 
129 aa  174  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  68.25 
 
 
126 aa  174  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09130  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 
129 aa  174  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  63.36 
 
 
131 aa  174  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  63.36 
 
 
131 aa  174  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  68.91 
 
 
133 aa  173  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  71.43 
 
 
128 aa  173  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  63.36 
 
 
131 aa  173  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0480  50S ribosomal protein L17  70.59 
 
 
128 aa  173  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000266808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  63.36 
 
 
131 aa  173  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4723  50S ribosomal protein L17  70.59 
 
 
128 aa  173  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51527  normal  0.268012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0509  50S ribosomal protein L17  70.59 
 
 
128 aa  173  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085747  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0513  50S ribosomal protein L17  70.59 
 
 
128 aa  173  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0326997 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  68.91 
 
 
133 aa  173  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  63.36 
 
 
131 aa  173  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  63.36 
 
 
131 aa  173  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0652  ribosomal protein L17  69.75 
 
 
128 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4523  50S ribosomal protein L17  69.75 
 
 
128 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 
130 aa  169  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  64.29 
 
 
127 aa  169  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  66.13 
 
 
132 aa  169  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>