70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0292 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3411  hypothetical protein  93.7 
 
 
413 aa  753  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  2.38547e-09  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0215  hypothetical protein  90.6 
 
 
415 aa  739  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000119575  unclonable  1.18774e-11 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0239  hypothetical protein  95.16 
 
 
413 aa  770  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000412577  hitchhiker  9.83728e-10 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0292  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  830  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00023062  unclonable  6.23109e-11 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0231  hypothetical protein  95.64 
 
 
413 aa  772  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  1.54041e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2794  hypothetical protein  99.01 
 
 
403 aa  801  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000181231  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0312  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  830  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000324654  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3116  putative lipoprotein  73.01 
 
 
416 aa  622  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00639042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3796  putative lipoprotein  73.25 
 
 
416 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  6.51588e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3857  putative lipoprotein  73.25 
 
 
416 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00112042  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0025  putative lipoprotein  73.01 
 
 
416 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  9.55667e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1963  putative lipoprotein  72.77 
 
 
416 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2088  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3130  putative lipoprotein  72.77 
 
 
416 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3517  putative lipoprotein  72.77 
 
 
416 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3526  putative lipoprotein  72.77 
 
 
416 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0274  putative lipoprotein  71.47 
 
 
414 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.83725e-06  unclonable  8.93699e-07 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3682  putative lipoprotein  71.72 
 
 
414 aa  552  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.77686e-05  unclonable  1.76343e-14 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1432  putative lipoprotein  60.29 
 
 
417 aa  471  1e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5177  hypothetical protein  60 
 
 
417 aa  464  1e-130  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397176  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3264  hypothetical protein  59.76 
 
 
417 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3169  putative lipoprotein  59.85 
 
 
417 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17692  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5104  hypothetical protein  59.76 
 
 
417 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3186  putative lipoprotein  59.61 
 
 
467 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0219261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3132  putative lipoprotein  59.85 
 
 
417 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0545  hypothetical protein  59.9 
 
 
417 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5041  hypothetical protein  59.53 
 
 
417 aa  461  1e-128  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0900  putative lipoprotein  59.61 
 
 
417 aa  459  1e-128  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4516  hypothetical protein  59.29 
 
 
417 aa  460  1e-128  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1876  putative lipoprotein  59.61 
 
 
417 aa  459  1e-128  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2011  putative lipoprotein  59.61 
 
 
417 aa  459  1e-128  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2733  putative lipoprotein  59.61 
 
 
417 aa  459  1e-128  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2024  putative lipoprotein  56.13 
 
 
419 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0718316  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2418  putative lipoprotein  57.08 
 
 
419 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.77944  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3444  putative lipoprotein  54.71 
 
 
429 aa  400  1e-110  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3592  hypothetical protein  54.59 
 
 
428 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3593  hypothetical protein  38.24 
 
 
436 aa  245  1e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3445  putative lipoprotein  36.7 
 
 
448 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3412  hypothetical protein  33.18 
 
 
473 aa  198  2e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000300706  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3518  hypothetical protein  32.98 
 
 
459 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3795  hypothetical protein  32.77 
 
 
457 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000690611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1964  hypothetical protein  32.77 
 
 
457 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3527  hypothetical protein  32.77 
 
 
457 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2591  hypothetical protein  32.77 
 
 
457 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3129  hypothetical protein  32.77 
 
 
457 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3856  hypothetical protein  32.77 
 
 
457 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.737102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0024  putative lipoprotein  32.77 
 
 
457 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00801483  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0293  hypothetical protein  33.89 
 
 
473 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0932383  unclonable  7.16846e-11 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0313  hypothetical protein  33.63 
 
 
473 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109698  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2793  hypothetical protein  33.63 
 
 
461 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0183447  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0216  hypothetical protein  32 
 
 
477 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0142102  unclonable  1.38018e-11 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1431  hypothetical protein  34.99 
 
 
532 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5105  hypothetical protein  41.09 
 
 
532 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3263  hypothetical protein  41.09 
 
 
532 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5042  hypothetical protein  40.35 
 
 
532 aa  190  3e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590905  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5176  hypothetical protein  40.8 
 
 
532 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373205  normal  0.653676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0544  hypothetical protein  40.35 
 
 
532 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4517  hypothetical protein  39.77 
 
 
532 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3115  hypothetical protein  33.04 
 
 
457 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00741759  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0232  hypothetical protein  32.51 
 
 
477 aa  185  2e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0240  hypothetical protein  32.58 
 
 
477 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0335347  hitchhiker  1.48251e-08 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0275  putative lipoprotein  32.92 
 
 
477 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108025  unclonable  1.13662e-06 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2732  hypothetical protein  35.27 
 
 
532 aa  180  5e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0899  hypothetical protein  35.27 
 
 
532 aa  180  5e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3170  hypothetical protein  35.27 
 
 
532 aa  180  5e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3133  hypothetical protein  35.27 
 
 
532 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3188  putative lipoprotein  35.27 
 
 
532 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0121789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1877  hypothetical protein  35.06 
 
 
532 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2025  hypothetical protein  36.27 
 
 
531 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.545482  normal  0.939283 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2419  hypothetical protein  35.75 
 
 
531 aa  176  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3681  putative lipoprotein  31.61 
 
 
476 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00175926  hitchhiker  6.79861e-13 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>