180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0291 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  100 
 
 
277 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  2.51819e-09  unclonable  4.17391e-11 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  98.92 
 
 
277 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  3.00179e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  98.92 
 
 
277 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  1.34393e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  96.39 
 
 
277 aa  505  1e-142  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  1.36478e-11  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  96.75 
 
 
277 aa  506  1e-142  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  6.89668e-10  unclonable  3.00165e-11 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  95.67 
 
 
277 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  5.79119e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  88.09 
 
 
276 aa  497  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  5.17916e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  88.09 
 
 
276 aa  497  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  88.09 
 
 
276 aa  497  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  88.09 
 
 
276 aa  497  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  5.41983e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  88.09 
 
 
276 aa  497  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  88.09 
 
 
276 aa  497  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  88.09 
 
 
276 aa  497  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  88.09 
 
 
276 aa  497  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  93.5 
 
 
277 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  1.52591e-12  unclonable  9.91303e-12 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  87.36 
 
 
276 aa  491  1e-138  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  1.264e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  71.84 
 
 
274 aa  406  1e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  1.2547e-12  unclonable  7.09917e-07 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  70.76 
 
 
274 aa  400  1e-110  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  2.86443e-08  unclonable  1.06929e-14 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  61.01 
 
 
274 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  61.01 
 
 
274 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  61.01 
 
 
274 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  60.65 
 
 
274 aa  343  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  61.01 
 
 
274 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  61.01 
 
 
274 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  57.55 
 
 
274 aa  328  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  57.19 
 
 
290 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  57.19 
 
 
290 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  57.19 
 
 
290 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  57.19 
 
 
290 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  57.19 
 
 
274 aa  318  8e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  56.47 
 
 
290 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  56.47 
 
 
274 aa  314  1e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  54.71 
 
 
282 aa  310  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  55.56 
 
 
286 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  56.08 
 
 
274 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  56.08 
 
 
274 aa  286  3e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  46.27 
 
 
306 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  46.27 
 
 
308 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  38.85 
 
 
241 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  39.93 
 
 
240 aa  174  2e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  39.71 
 
 
241 aa  172  7e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  37.77 
 
 
241 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  38.13 
 
 
241 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  6.5316e-07 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  38.76 
 
 
241 aa  164  1e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  38.76 
 
 
241 aa  164  1e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  38.76 
 
 
241 aa  164  1e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  38.61 
 
 
243 aa  164  2e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  38.61 
 
 
243 aa  164  2e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  38.61 
 
 
243 aa  164  2e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  38.61 
 
 
243 aa  164  2e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  38.61 
 
 
243 aa  164  2e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  38.61 
 
 
243 aa  164  2e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  38.61 
 
 
243 aa  164  2e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  38.08 
 
 
241 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  36.86 
 
 
243 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  37.15 
 
 
239 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  36.76 
 
 
239 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  37.69 
 
 
246 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  36.78 
 
 
243 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  36.46 
 
 
241 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4190  OmpW family protein  33.33 
 
 
464 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  34.75 
 
 
243 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3327  OmpW family protein  33.33 
 
 
464 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  36.02 
 
 
243 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  34.75 
 
 
243 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4176  OmpW  33.33 
 
 
464 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.504746  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  35.63 
 
 
243 aa  148  1e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  35.63 
 
 
243 aa  148  1e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  34.4 
 
 
243 aa  148  1e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  34.91 
 
 
246 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1835  OmpW family protein  31.65 
 
 
463 aa  141  2e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.306199  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  33.59 
 
 
245 aa  131  1e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0288  putative lipoprotein  29.9 
 
 
498 aa  128  8e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0277  putative lipoprotein  29.9 
 
 
498 aa  128  8e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.561631  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1319  putative lipoprotein  29.9 
 
 
498 aa  128  8e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.598416  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1731  OmpW family outer membrane protein  29.9 
 
 
498 aa  128  9e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1815  OmpW family outer membrane protein  29.9 
 
 
498 aa  128  9e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1003  hypothetical protein  30.07 
 
 
277 aa  128  1e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1141  putative lipoprotein  29.55 
 
 
504 aa  128  1e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.917542  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  29.96 
 
 
382 aa  118  9e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  33.2 
 
 
248 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2401  putative outer membrane protein  28.1 
 
 
371 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.675922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  28.78 
 
 
228 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  30.32 
 
 
210 aa  86.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  29.03 
 
 
223 aa  86.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  1.69515e-05 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  26.98 
 
 
217 aa  81.3  2e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  26.74 
 
 
237 aa  78.6  1e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  28.52 
 
 
210 aa  77.4  2e-13  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  28.42 
 
 
210 aa  75.1  1e-12  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  24.55 
 
 
213 aa  75.1  1e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  25.27 
 
 
218 aa  73.9  3e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  27.91 
 
 
232 aa  73.9  3e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  24.82 
 
 
214 aa  73.2  4e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  27.7 
 
 
210 aa  72.8  6e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  26.6 
 
 
232 aa  71.2  2e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  26.6 
 
 
232 aa  70.5  3e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  26.88 
 
 
209 aa  69.7  5e-11  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  1.28049e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  25.59 
 
 
228 aa  69.7  5e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  26.16 
 
 
213 aa  68.9  9e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  24.91 
 
 
211 aa  67.8  2e-10  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>