More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0225 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 707 aa  1444    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  96.46 
 
 		 738 aa  1374    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  54.61 
 
 		 742 aa  753    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  99.72 
 
 		 707 aa  1442    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  99.72 
 
 		 707 aa  1441    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  39.57 
 
 		 727 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  38.86 
 
 		 727 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  37.86 
 
 		 726 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  39.63 
 
 		 706 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  37.06 
 
 		 728 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  37.78 
 
 		 685 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  35 
 
 		 715 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 743 aa  265  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  32.01 
 
 		 751 aa  262  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 		 743 aa  261  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  31.15 
 
 		 705 aa  261  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 743 aa  257  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 719 aa  254  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 710 aa  254  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 		 729 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 		 702 aa  251  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  30.96 
 
 		 743 aa  250  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  30.96 
 
 		 743 aa  250  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  30.96 
 
 		 743 aa  250  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 702 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 729 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 712 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 		 728 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 710 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 		 728 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 716 aa  225  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 774 aa  225  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 		 772 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 		 772 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 737 aa  223  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 805 aa  221  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 698 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  30.36 
 
 		 722 aa  217  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2394  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 729 aa  216  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 730 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  30.06 
 
 		 726 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.79 
 
 		 724 aa  213  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  30.61 
 
 		 819 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 718 aa  212  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 724 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 758 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 730 aa  207  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.08 
 
 		 704 aa  205  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  26.45 
 
 		 750 aa  205  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  28.33 
 
 		 809 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 811 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 712 aa  200  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 708 aa  200  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 811 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  29.9 
 
 		 804 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  29.08 
 
 		 744 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 772 aa  198  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 727 aa  196  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 761 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  29.45 
 
 		 804 aa  194  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 823 aa  193  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 755 aa  192  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 729 aa  192  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 724 aa  192  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 708 aa  191  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  30.06 
 
 		 746 aa  191  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  29.16 
 
 		 753 aa  190  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  30.79 
 
 		 722 aa  188  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  29.63 
 
 		 737 aa  188  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 710 aa  186  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 729 aa  186  9e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  29.39 
 
 		 771 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1495  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.02 
 
 		 711 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.454643 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 757 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 729 aa  185  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 725 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 731 aa  181  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 742 aa  181  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 756 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  28.22 
 
 		 763 aa  180  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 802 aa  180  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 768 aa  180  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  27.85 
 
 		 720 aa  178  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  28.53 
 
 		 804 aa  177  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 764 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 753 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 808 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 804 aa  168  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 		 710 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 761 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 759 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 800 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  25.56 
 
 		 730 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 839 aa  163  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  26.73 
 
 		 773 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 801 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 851 aa  161  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 768 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 801 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 879 aa  160  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>