253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0214 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0214  RelA/SpoT domain-containing protein  100 
 
 
353 aa  731    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000343543  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2442  RelA/SpoT domain-containing protein  38.87 
 
 
340 aa  238  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0452  RelA/SpoT domain protein  32.21 
 
 
350 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000576608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1420  RelA/SpoT domain protein  31.04 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.39446e-22 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3432  hypothetical protein  34.17 
 
 
341 aa  146  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000798174  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0840  RelA/SpoT  25.82 
 
 
423 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000281443  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1321  RelA/SpoT domain-containing protein  25.82 
 
 
423 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000180036  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1920  GTP pyrophosphokinase  35.97 
 
 
718 aa  65.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.682982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  30.52 
 
 
210 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  35.4 
 
 
212 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  35.4 
 
 
212 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  35.4 
 
 
215 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  35.4 
 
 
212 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1735  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  36.92 
 
 
747 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  34.21 
 
 
212 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  35.4 
 
 
212 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  35.4 
 
 
212 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  35.4 
 
 
212 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  35.4 
 
 
212 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  35.4 
 
 
212 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  30.72 
 
 
212 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  34.51 
 
 
212 aa  63.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  37.72 
 
 
271 aa  63.5  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  35.48 
 
 
208 aa  60.5  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4217  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  33.85 
 
 
747 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.630753  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  29.03 
 
 
216 aa  60.1  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  29.11 
 
 
216 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  29.11 
 
 
216 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  29.11 
 
 
216 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  29.11 
 
 
216 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  29.11 
 
 
216 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  29.11 
 
 
216 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  29.11 
 
 
216 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  32.43 
 
 
226 aa  57.4  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1694  GTP pyrophosphokinase  33.85 
 
 
744 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1400  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.3 
 
 
705 aa  57.4  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  28.39 
 
 
216 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3695  RelA/SpoT protein  33.85 
 
 
747 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120676  hitchhiker  0.00160014 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0731  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.07 
 
 
769 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.583794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4576  GTP pyrophosphokinase  33.08 
 
 
747 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52180  GTP pyrophosphokinase  33.08 
 
 
747 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00224344  normal  0.0200902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37060  RelA/SpoT protein  35.11 
 
 
749 aa  56.6  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00582579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3389  GDP/GTP pyrophosphokinase  33.85 
 
 
744 aa  56.2  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3548  GDP/GTP pyrophosphokinase  33.85 
 
 
745 aa  56.2  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000488354  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1656  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.08 
 
 
746 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.764333  normal  0.672411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1217  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.85 
 
 
746 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.212214  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1257  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.08 
 
 
746 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.648227  normal  0.0100627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2856  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.28 
 
 
749 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0013983  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  27.74 
 
 
216 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4062  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.08 
 
 
746 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.733474  normal  0.507158 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  28.39 
 
 
217 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0815  GDP/GTP pyrophosphokinase  33.08 
 
 
745 aa  54.7  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  29.85 
 
 
191 aa  54.3  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2238  GTP diphosphokinase  33.08 
 
 
746 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.338893  hitchhiker  0.000119577 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4366  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.99 
 
 
736 aa  53.9  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.172141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3353  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.08 
 
 
735 aa  53.5  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000634706  hitchhiker  0.000162185 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1576  GTP pyrophosphokinase  31.25 
 
 
746 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1052  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.81 
 
 
733 aa  53.5  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  26.63 
 
 
263 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  26.63 
 
 
263 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  31.03 
 
 
267 aa  53.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2530  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.38 
 
 
789 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471952  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2802  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.92 
 
 
750 aa  53.1  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.353493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2565  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 
710 aa  53.1  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00145552  hitchhiker  0.00000902572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2238  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.68 
 
 
745 aa  53.1  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  31.58 
 
 
216 aa  52.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02629  (p)ppGpp synthetase I/GTP pyrophosphokinase  30.99 
 
 
744 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000829976  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0904  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.99 
 
 
744 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000660798  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0005  GTP pyrophosphokinase  31.82 
 
 
728 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  30.09 
 
 
230 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1287  GTP diphosphokinase  33.08 
 
 
735 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000126799  unclonable  0.000000000190177 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2922  GDP/GTP pyrophosphokinase  30.99 
 
 
744 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000016084  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3089  GDP/GTP pyrophosphokinase  30.99 
 
 
744 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000014869  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  30.09 
 
 
230 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_5  relA/spoT protein, GTP pyrophosphokinase  31.82 
 
 
728 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0928  GDP/GTP pyrophosphokinase  30.99 
 
 
744 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000382583  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2029  GTP pyrophosphokinase  30 
 
 
738 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178935  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3115  GDP/GTP pyrophosphokinase  30.99 
 
 
744 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0106723  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  27.22 
 
 
211 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3178  GDP/GTP pyrophosphokinase  30.99 
 
 
744 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00141228  normal  0.185279 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2928  GDP/GTP pyrophosphokinase  30.99 
 
 
744 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000188713  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3097  GDP/GTP pyrophosphokinase  30.99 
 
 
744 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000040075  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3162  GDP/GTP pyrophosphokinase  30.99 
 
 
744 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00447218  normal  0.0412564 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2113  GTP diphosphokinase  34.4 
 
 
770 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.978919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  27.22 
 
 
211 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0005  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.07 
 
 
728 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3088  GDP/GTP pyrophosphokinase  30.99 
 
 
744 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000221392  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3276  GDP/GTP pyrophosphokinase  30.99 
 
 
744 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00140611  normal  0.0304818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1588  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.99 
 
 
753 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.870499  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02591  hypothetical protein  30.99 
 
 
744 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000104096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4044  GDP/GTP pyrophosphokinase  30.99 
 
 
744 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000409177  normal  0.332873 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.11 
 
 
705 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  31.11 
 
 
705 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2587  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.1 
 
 
747 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111478  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0343  putative RelA/SpoT family protein  33.1 
 
 
846 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000094604  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0377  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  33.1 
 
 
846 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000730209  normal  0.0150948 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2576  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.37 
 
 
705 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0223055 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  36.28 
 
 
224 aa  50.8  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0804  RelA/SpoT family protein  31.54 
 
 
706 aa  50.8  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0530  (p)ppGpp synthetase I and guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  30.77 
 
 
737 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000055023  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>