More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0145 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
294 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  99.32 
 
 
294 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  99.32 
 
 
294 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  96.26 
 
 
294 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  94.9 
 
 
296 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  93.88 
 
 
296 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  94.22 
 
 
294 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2016  LysR family transcriptional regulator  60.88 
 
 
297 aa  362  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4864  LysR family transcriptional regulator  54.24 
 
 
297 aa  327  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0915  transcriptional regulator, LysR family  55.59 
 
 
314 aa  318  7e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3751  transcriptional regulator, LysR family  53.4 
 
 
298 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.587681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35890  Regulatory protein, LysR family  53.06 
 
 
309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3033  LysR family transcriptional regulator  51.7 
 
 
305 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0273235  normal  0.89504 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4908  LysR family transcriptional regulator  52.28 
 
 
299 aa  298  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3565  transcriptional regulator, LysR family  52.38 
 
 
298 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1818  LysR family transcriptional regulator  52.58 
 
 
297 aa  296  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2638  LysR family transcriptional regulator  52.9 
 
 
294 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5921  LysR family transcriptional regulator  54.27 
 
 
294 aa  292  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0707  LysR family transcriptional regulator  53.92 
 
 
294 aa  291  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256747  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1980  LysR family transcriptional regulator  52.56 
 
 
294 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2590  LysR family transcriptional regulator  52.56 
 
 
294 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0880  LysR family transcriptional regulator  52.04 
 
 
294 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.803519  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2614  LysR family transcriptional regulator  52.22 
 
 
294 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0339  LysR family transcriptional regulator  51.7 
 
 
294 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2473  LysR family transcriptional regulator  51.7 
 
 
294 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1042  LysR family transcriptional regulator  51.7 
 
 
294 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0638  LysR family transcriptional regulator  51.7 
 
 
294 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0979  LysR family transcriptional regulator  51.36 
 
 
307 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039685  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0086  LysR family transcriptional regulator  51.7 
 
 
294 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0883  LysR family transcriptional regulator  51.36 
 
 
294 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.427217  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3137  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 
323 aa  285  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3691  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 
299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17760  Transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 
299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  46.94 
 
 
298 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0459  transcriptional regulator, LysR family  48.65 
 
 
297 aa  282  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  45.86 
 
 
305 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2944  putative transcriptional regulator  48.98 
 
 
297 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625117  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34690  LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 
297 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0262778  normal  0.106193 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0231  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 
300 aa  275  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3304  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 
313 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0884385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1454  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 
296 aa  271  8.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.508797  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1997  LysR family transcriptional regulator  47.96 
 
 
298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3196  transcriptional regulator, LysR family  43.88 
 
 
304 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00241672  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4096  transcriptional regulator, LysR family  46.26 
 
 
308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0401  transcriptional regulator, LysR family  47.28 
 
 
299 aa  256  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0508531  normal  0.660201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6823  LysR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1711  transcriptional regulator, LysR family  46.26 
 
 
300 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.530913  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3280  LysR family transcriptional regulator  77.27 
 
 
156 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 
304 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  42.71 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  41.89 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  42.52 
 
 
305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.01 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
334 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
334 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
334 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
334 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
334 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
334 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
295 aa  218  7e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  40 
 
 
315 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
334 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 
342 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
303 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  42.31 
 
 
300 aa  217  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2413  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
323 aa  215  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
306 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
298 aa  215  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  39.38 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5951  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 
305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  39.19 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  41.96 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 
305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
340 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 
334 aa  212  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09910  putative transcriptional regulator  38.93 
 
 
307 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280275  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
334 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4738  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
306 aa  211  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.44438  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
334 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
295 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
334 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2356  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 
307 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118407  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3287  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 
299 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  38.51 
 
 
300 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2040  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
301 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
334 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
303 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
303 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>