59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0065 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  100 
 
 
82 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  100 
 
 
82 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  100 
 
 
82 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  61.54 
 
 
80 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  56.41 
 
 
85 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  53.66 
 
 
81 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  59.26 
 
 
80 aa  90.9  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  55 
 
 
82 aa  90.5  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4538  prevent-host-death family protein  57.5 
 
 
82 aa  87  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  50.62 
 
 
95 aa  84.3  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0775  prevent-host-death protein  48.75 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  49.38 
 
 
82 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2184  prevent-host-death family protein  46.34 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.415142  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  50 
 
 
78 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  45.12 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  47.5 
 
 
82 aa  63.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1037  prevent-host-death family protein  49.35 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0199  prevent-host-death family protein  48.28 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172056  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  46.34 
 
 
76 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  45 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  50.77 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  49.23 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1572  prevent host death protein  40.24 
 
 
80 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677398  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2443  prevent-host-death family protein  47.69 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0810105  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  41.25 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2910  prevent-host-death family protein  50.88 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293709  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  44.29 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0414  prevent host death protein  37.35 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  38.67 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0577  prevent-host-death family protein  37.35 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  41.03 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3738  prevent-host-death family protein  41.33 
 
 
77 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  42.37 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0707  prevent-host-death family protein  38.64 
 
 
89 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0629  prevent-host-death family protein  36.36 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.285054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4124  prevent-host-death family protein  41.43 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  43.94 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6300  hypothetical protein  41.18 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0655  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  42.59 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1777  prevent-host-death family protein  40 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2637  prevent-host-death protein  32.35 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5378  prevent-host-death family protein  35.82 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963401 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2647  prevent-host-death family protein  46.3 
 
 
89 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  43.94 
 
 
79 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3825  prevent-host-death protein  35.71 
 
 
89 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  50 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 
79 aa  43.9  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4033  hypothetical protein  36.92 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.69102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1573  prevent-host-death family protein  36.36 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  41.18 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2334  prevent-host-death protein  39.71 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  31.94 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3527  prevent-host-death family protein  43.14 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378115  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2969  prevent-host-death family protein  39.71 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.686519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2948  prevent-host-death family protein  39.71 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183383  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  41.67 
 
 
104 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  43.14 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4044  prevent-host-death protein  32.5 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.104043  normal  0.215101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>