More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0051 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
282 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  99.65 
 
 
285 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.090458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  99.65 
 
 
285 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3216  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  95.04 
 
 
285 aa  484  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.04 
 
 
285 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.54 
 
 
285 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2678  ABC transporter, permease protein  92.2 
 
 
285 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0253  ABC transporter, permease protein  92.2 
 
 
282 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.735185  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0037  ABC transporter, permease protein  93.44 
 
 
259 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.17 
 
 
282 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.91 
 
 
287 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3274  ABC transporter, permease protein  92.2 
 
 
282 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1853  ABC transporter, permease protein  92.2 
 
 
282 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0040  ABC transporter, permease protein  92.2 
 
 
282 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0040  ABC transporter, permease protein  92.2 
 
 
282 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.522623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2699  ABC transporter, permease protein  92.2 
 
 
282 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0493  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  85.92 
 
 
287 aa  441  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114665  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.2 
 
 
287 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753159  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.94 
 
 
295 aa  371  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.4 
 
 
295 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3330  ABC transporter membrane spanning protein  55.6 
 
 
295 aa  322  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.07 
 
 
283 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.35 
 
 
293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.877762  normal  0.739003 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5341  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.35 
 
 
293 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.09 
 
 
294 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0684117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.94 
 
 
302 aa  272  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.033554  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.14 
 
 
259 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947992  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.24 
 
 
276 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.24 
 
 
276 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.23 
 
 
271 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.94 
 
 
263 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.53 
 
 
263 aa  208  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1200  transmembrane permease ABC transporter protein  45.31 
 
 
263 aa  205  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.441856  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.35 
 
 
274 aa  201  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3278  ABC transporter related protein  46.41 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000407876  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.57 
 
 
264 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.64 
 
 
263 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243564  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.97 
 
 
277 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.75 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2103  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.02 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2355  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  43.86 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214574  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324199  normal  0.863766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 
266 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 
274 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.146122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6067  ABC transporter permease  45.38 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.69 
 
 
262 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0261  ABC transporter, permease protein  44.71 
 
 
263 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.597346  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0285  ABC transporter, permease protein  43.92 
 
 
263 aa  185  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
283 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
329 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2107  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.35 
 
 
265 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3334  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.74 
 
 
265 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.227064  normal  0.190195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.63 
 
 
268 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0794658  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
272 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
271 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.101401  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
279 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
279 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
279 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
278 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000965537  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
292 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
269 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  34.47 
 
 
282 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
269 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
268 aa  133  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4517  ABC transporter, permease  34.33 
 
 
268 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4923  ABC transporter, permease protein  34.33 
 
 
268 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
267 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4677  ABC transporter permease  33.91 
 
 
268 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4536  ABC transporter, permease  33.91 
 
 
268 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
274 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00112224  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5038  ABC transporter permease  33.91 
 
 
268 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4902  ABC transporter, permease protein  33.91 
 
 
268 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4937  ABC transporter, permease protein  33.48 
 
 
268 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4903  ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 
268 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.46 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0335  ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 
268 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
280 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
281 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.71 
 
 
273 aa  122  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.48 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
274 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.240571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1306  ABC transporter, permease component  32.93 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334764  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.39 
 
 
259 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1812  ABC transporter, permease protein  29.67 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.554956  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.24 
 
 
246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
281 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
289 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276752  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.74 
 
 
261 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
254 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.78 
 
 
277 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>