80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0016 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  100 
 
 		 312 aa  634    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  33.11 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  35.06 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  35.06 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  35.06 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  35.06 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  29.11 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  28.97 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  29.25 
 
 		 377 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  35.42 
 
 		 335 aa  92.8  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  26.74 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1703  hypothetical protein  25.35 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  24.43 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  32.65 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  30.82 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  30.82 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  30.82 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1341  hypothetical protein  30.21 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  normal  0.280158 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  26.37 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  26.37 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0029  transposition helper protein  27.78 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  25.47 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  25.86 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  22.69 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  25.86 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  23.13 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  27.31 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  24.6 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  28.24 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06977  hypothetical protein  31.21 
 
 		 196 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  27.01 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  27.36 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  24.33 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  24.31 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  27.81 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  27.81 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  27.59 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  23.57 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  25.41 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2537  hypothetical protein  26.38 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  22.65 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  20.68 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  26.44 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  25.86 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  26.07 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  26.07 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1630  hypothetical protein  25.1 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  20.43 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  20.43 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  20.43 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  20.75 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  21.74 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  26.55 
 
 		 362 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2176  hypothetical protein  26.4 
 
 		 316 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.476118  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  24.89 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  23.05 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  22.92 
 
 		 292 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  24.55 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  25.27 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  28.37 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  23.95 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0497  hypothetical protein  24.17 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  23.95 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  23.95 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  23.95 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  23.31 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  23.31 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  23.31 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  23.31 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  24.68 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  25 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1518  hypothetical protein  25.54 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558401  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1191  hypothetical protein  30.46 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  0.2185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1037  AAA ATPase  25.81 
 
 		 388 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  25 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2089  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.705545  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  27.82 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  24.26 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4716  hypothetical protein  22.69 
 
 		 354 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0424  AAA ATPase  29.6 
 
 		 340 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.629135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>