19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0014 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0014  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0005  hypothetical protein  31.11 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0007  hypothetical protein  31.11 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0005  hypothetical protein  31.11 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0200197  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0024  hypothetical protein  36.78 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2178  hypothetical protein  34 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  30.3 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6542  hypothetical protein  31.65 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  32.93 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  32.93 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4424  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  42  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  30.53 
 
 		 205 aa  42  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 905 aa  41.6  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 905 aa  41.6  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 905 aa  41.6  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 905 aa  41.6  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 905 aa  41.6  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2137  TnsA endonuclease  27.64 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0160044 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2506  transposon transposase protein A, putative  27.64 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>