More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0001 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3182  chromosomal replication initiation protein  98.48 
 
 
525 aa  1063  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.143434  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0001  chromosomal replication initiation protein  87.05 
 
 
518 aa  892  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470324 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
525 aa  1077  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.54964 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0103  chromosomal replication initiation protein  87.04 
 
 
533 aa  920  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0089  chromosomal replication initiation protein  87.04 
 
 
533 aa  920  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0301  chromosomal replication initiation protein  87.04 
 
 
533 aa  920  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0001  chromosomal replication initiation protein  86.48 
 
 
518 aa  884  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2848  chromosomal replication initiation protein  87.04 
 
 
533 aa  920  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2237  chromosomal replication initiation protein  86.85 
 
 
533 aa  919  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0001  chromosomal replication initiation protein  98.67 
 
 
525 aa  1060  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470928  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0001  chromosomal replication initiation protein  99.62 
 
 
525 aa  1072  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0001  chromosomal replication initiation protein  86.85 
 
 
533 aa  919  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0001  chromosomal replication initiation protein  97.33 
 
 
524 aa  975  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57647  hitchhiker  1.95718e-05 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4462  chromosomal replication initiation protein  94.47 
 
 
544 aa  735  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369414  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2553  chromosomal replication initiation protein  99.62 
 
 
561 aa  1073  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0001  chromosomal replication initiation protein  74.77 
 
 
529 aa  782  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0001  chromosomal replication initiation protein  68.9 
 
 
579 aa  767  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0001  chromosomal replication initiation protein  74.58 
 
 
529 aa  781  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3239  chromosomal replication initiation protein  86.43 
 
 
536 aa  896  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457996  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  64.94 
 
 
475 aa  676  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.202829  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0001  chromosomal replication initiation protein  94.47 
 
 
545 aa  736  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3442  chromosomal replication initiation protein  73.28 
 
 
522 aa  783  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807856  normal  0.719643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0001  chromosomal replication initiation protein  98.67 
 
 
525 aa  1060  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.375862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0001  chromosomal replication initiation protein  66.72 
 
 
584 aa  753  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293288  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  84.73 
 
 
474 aa  610  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0537995  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4144  chromosomal replication initiation protein  57.55 
 
 
473 aa  586  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0001  chromosomal replication initiation protein  57.55 
 
 
475 aa  583  1e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.738182  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0001  chromosomal replication initiation protein  56.6 
 
 
468 aa  574  1e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0688864  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0001  chromosomal replication initiation protein  57.98 
 
 
510 aa  574  1e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.51615e-05 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0001  chromosomal replication initiation protein  55.87 
 
 
467 aa  568  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.720821  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0001  chromosomal replication initiation protein  57.93 
 
 
459 aa  569  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0624121  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0001  chromosomal replication initiation protein  54.31 
 
 
500 aa  546  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0001  chromosomal replication initiation protein  53.33 
 
 
476 aa  542  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00109258  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.82 
 
 
470 aa  538  1e-152  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.33107e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0001  chromosomal replication initiation protein  71.67 
 
 
473 aa  540  1e-152  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0001  chromosomal replication initiation protein  69.41 
 
 
464 aa  536  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.789649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0001  chromosomal replication initiation protein  51.42 
 
 
465 aa  531  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.0295e-06  decreased coverage  0.002869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0001  chromosomal replication initiation protein  66.93 
 
 
483 aa  526  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4117  chromosomal replication initiation protein  73.75 
 
 
465 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  9.31933e-05  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0001  chromosomal replication initiation protein  70.99 
 
 
470 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  8.52444e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  49.71 
 
 
495 aa  489  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  49.62 
 
 
524 aa  491  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  67.66 
 
 
457 aa  484  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  48.85 
 
 
462 aa  481  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.10804e-08  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.94 
 
 
464 aa  478  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  50.57 
 
 
511 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  48.85 
 
 
462 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  48.46 
 
 
463 aa  480  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.17775e-05  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  50.09 
 
 
510 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0001  chromosomal replication initiation protein  49.62 
 
 
512 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  48.08 
 
 
462 aa  478  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.11976e-10  n/a   
 
 
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  47.79 
 
 
462 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.62887e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  47.79 
 
 
462 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.57358e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  47.41 
 
 
459 aa  475  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  7.81636e-06  unclonable  3.44978e-06 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  47.79 
 
 
462 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.98931e-09  unclonable  3.43779e-12 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  49.43 
 
 
494 aa  478  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  47.79 
 
 
462 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.57699e-06  unclonable  1.21376e-05 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.46 
 
 
462 aa  472  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  49.04 
 
 
467 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  5.58594e-06  normal  0.0494414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  48.94 
 
 
467 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  49.71 
 
 
478 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  47.41 
 
 
460 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.81375e-07  unclonable  6.00935e-11 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  47.56 
 
 
461 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.02323e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  48.94 
 
 
467 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.26813e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  48.94 
 
 
467 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.01887e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  48.94 
 
 
467 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  48.94 
 
 
467 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.02031e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  48.94 
 
 
467 aa  471  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  6.6194e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  49.33 
 
 
467 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  48.27 
 
 
462 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.81438e-07  unclonable  1.18337e-08 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.94 
 
 
467 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.36922e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  47.8 
 
 
451 aa  471  1e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  7.64641e-07  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  47.6 
 
 
461 aa  471  1e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  5.1e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  48.63 
 
 
450 aa  468  1e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  6.34969e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  49.04 
 
 
465 aa  468  1e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  47.5 
 
 
462 aa  467  1e-130  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  4.03403e-07  unclonable  1.36332e-10 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  48.47 
 
 
465 aa  467  1e-130  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00010  chromosomal replication initiation protein  48.58 
 
 
514 aa  468  1e-130  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373198  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  46.83 
 
 
460 aa  467  1e-130  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.79736e-07  unclonable  3.13535e-11 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  48.65 
 
 
466 aa  468  1e-130  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.44177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  46.83 
 
 
460 aa  466  1e-130  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  7.24276e-06  unclonable  1.76e-05 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  48.65 
 
 
466 aa  468  1e-130  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  48.65 
 
 
466 aa  468  1e-130  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  47.5 
 
 
472 aa  465  1e-130  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.51721e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  48.65 
 
 
466 aa  468  1e-130  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  48.08 
 
 
466 aa  467  1e-130  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  46.83 
 
 
460 aa  463  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  48.32 
 
 
468 aa  458  1e-128  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  5.52796e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.31 
 
 
474 aa  458  1e-128  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.47 
 
 
511 aa  460  1e-128  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  48.51 
 
 
468 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.66 
 
 
516 aa  454  1e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  3.522e-07  unclonable  7.22922e-12 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  46.2 
 
 
452 aa  448  1e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  46.2 
 
 
452 aa  448  1e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  59.21 
 
 
457 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.24276e-07  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  61.31 
 
 
455 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  60.83 
 
 
461 aa  442  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  2.63579e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00002  Chromosomal replication initiator protein dnaA  60.53 
 
 
533 aa  441  1e-122  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  9.17685e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56 
 
 
461 aa  440  1e-122  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0001  chromosomal replication initiation protein  61.31 
 
 
507 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366311  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>