23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6534 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  99.23 
 
 		 4238 aa  706    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6534  outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 415 aa  751    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0435676  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 4238 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  82.37 
 
 		 3954 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  52.55 
 
 		 2365 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  53.01 
 
 		 2366 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  50.46 
 
 		 2396 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  53.53 
 
 		 2346 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  51.52 
 
 		 1508 aa  269  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  52.66 
 
 		 2371 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  39.15 
 
 		 3506 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  40.05 
 
 		 2711 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.55 
 
 		 3629 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  42.62 
 
 		 3415 aa  47.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 		 1113 aa  47.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  42.62 
 
 		 3420 aa  47.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.57 
 
 		 1357 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  54.43 
 
 		 3822 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  43.96 
 
 		 1530 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  51.85 
 
 		 1861 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  51.85 
 
 		 2578 aa  43.9  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  52.08 
 
 		 1882 aa  43.1  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  51.85 
 
 		 2906 aa  43.1  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>