More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6478 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 479 aa  947    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 479 aa  947    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  46 
 
 		 483 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  42.83 
 
 		 467 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  44.32 
 
 		 464 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  39.58 
 
 		 481 aa  343  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  40.93 
 
 		 484 aa  342  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  40.83 
 
 		 495 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  43.75 
 
 		 485 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  38.67 
 
 		 484 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  40.17 
 
 		 488 aa  309  6.999999999999999e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  37.01 
 
 		 509 aa  296  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  37.6 
 
 		 509 aa  296  6e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  37.01 
 
 		 510 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  38.2 
 
 		 516 aa  293  4e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  40.42 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  40.52 
 
 		 486 aa  291  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  43.77 
 
 		 497 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  39.73 
 
 		 497 aa  286  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  35.73 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  36.31 
 
 		 490 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  38.56 
 
 		 504 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  34.55 
 
 		 516 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  36.44 
 
 		 492 aa  253  6e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 		 513 aa  252  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  33.88 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  33.82 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  33.82 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  33.82 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  34.19 
 
 		 485 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  39.18 
 
 		 498 aa  247  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  31.9 
 
 		 504 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  35.37 
 
 		 502 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  32.43 
 
 		 493 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  38.22 
 
 		 483 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  37.97 
 
 		 496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  32.21 
 
 		 527 aa  234  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 487 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 		 474 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  35.89 
 
 		 491 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 486 aa  216  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  34.32 
 
 		 507 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 		 450 aa  104  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 521 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  28.4 
 
 		 434 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  26.07 
 
 		 492 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  26.07 
 
 		 492 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 		 469 aa  98.6  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  26.82 
 
 		 459 aa  98.2  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 492 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 497 aa  94.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  28.46 
 
 		 461 aa  93.6  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  26.3 
 
 		 443 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  22.55 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 477 aa  80.5  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 507 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 		 454 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2580  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  24.18 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  25.19 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 475 aa  75.9  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 501 aa  75.5  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  23.89 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  27.01 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  23.57 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 502 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 		 511 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  21.85 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  23.7 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  22.33 
 
 		 506 aa  73.9  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  25.63 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  23.32 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 447 aa  73.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  24.66 
 
 		 449 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  24.83 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  24.66 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  23.82 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  25 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1513  amino acid transporter  24.22 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.490527  hitchhiker  0.0000000124915 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 482 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  24 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1963  amino acid transporter  23.62 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.041678  hitchhiker  0.00000000765672 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  24 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1476  amino acid transporter  24.22 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.161402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1792  amino acid transporter  24.22 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000593149  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  25.15 
 
 		 506 aa  67.8  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1639  amino acid permease-associated region  23 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00236467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>