More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6406 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
233 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
233 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
233 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  96.14 
 
 
233 aa  459  1e-128  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
232 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
246 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
243 aa  161  8e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  37.39 
 
 
239 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
231 aa  155  5e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
243 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
222 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
225 aa  115  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 
238 aa  115  7e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  35.08 
 
 
239 aa  114  1e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
223 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
214 aa  112  4e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  37.82 
 
 
227 aa  110  2e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  34.66 
 
 
227 aa  110  2e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
249 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
229 aa  108  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 
223 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  33.33 
 
 
240 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  33.33 
 
 
240 aa  108  8e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
255 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
255 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
229 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  34.58 
 
 
223 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
230 aa  106  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 
228 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 
266 aa  105  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
247 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
234 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  2.30253e-05 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 
228 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
230 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  1.04073e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
238 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  2.523e-09 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 
223 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 
263 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  31.63 
 
 
263 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 
238 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 
238 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  3.70874e-05 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 
238 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  33 
 
 
228 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
222 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
239 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 
240 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 
232 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
254 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
241 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
231 aa  102  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  31.55 
 
 
240 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  31.73 
 
 
239 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 
228 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  37.71 
 
 
242 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
260 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
251 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
228 aa  99  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 
237 aa  98.2  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
230 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
236 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
226 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
227 aa  96.3  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
240 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
254 aa  95.5  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 
231 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  31.87 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
232 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
233 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 
221 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
261 aa  92.4  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  1.86795e-06  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 
225 aa  92  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 
232 aa  92  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
236 aa  91.7  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  2.18035e-05  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
232 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1007  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
234 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.511541  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
238 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  32.45 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
238 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 
215 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 
243 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
229 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
254 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 
274 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 
265 aa  89  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>