More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6367 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  54.83 
 
 		 893 aa  957    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  53.99 
 
 		 906 aa  939    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  57.59 
 
 		 914 aa  1017    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  76.17 
 
 		 903 aa  1330    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  60.75 
 
 		 935 aa  1075    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  57.38 
 
 		 913 aa  1005    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  99.68 
 
 		 941 aa  1907    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 941 aa  1912    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  54.1 
 
 		 906 aa  942    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  54.1 
 
 		 906 aa  942    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 941 aa  1912    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  37.81 
 
 		 874 aa  544  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  34.4 
 
 		 879 aa  487  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 927 aa  303  7.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 928 aa  300  6e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  28.36 
 
 		 827 aa  298  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 948 aa  295  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 869 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 944 aa  282  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 901 aa  279  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 884 aa  278  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  30.07 
 
 		 877 aa  272  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 852 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  28.52 
 
 		 880 aa  271  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 904 aa  270  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 849 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 875 aa  258  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 855 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 861 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 861 aa  253  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 861 aa  253  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 861 aa  252  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 861 aa  252  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  28.46 
 
 		 834 aa  249  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 861 aa  250  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 872 aa  249  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 891 aa  245  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 847 aa  245  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 871 aa  241  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 1001 aa  239  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 857 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 890 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  26.4 
 
 		 866 aa  233  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 890 aa  233  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 868 aa  232  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 910 aa  230  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 942 aa  228  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 950 aa  227  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 867 aa  225  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 867 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 869 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 854 aa  222  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 867 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 800 aa  221  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 882 aa  220  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 882 aa  219  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 991 aa  218  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 867 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 886 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 892 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 886 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 912 aa  213  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 925 aa  213  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 953 aa  212  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  25.21 
 
 		 922 aa  210  8e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 866 aa  209  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2169  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 1064 aa  204  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.576978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 907 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 1055 aa  202  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  23.81 
 
 		 896 aa  202  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 894 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 909 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 896 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 876 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  24.04 
 
 		 895 aa  198  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  24.6 
 
 		 899 aa  199  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 956 aa  195  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  24.12 
 
 		 893 aa  194  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 883 aa  193  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 908 aa  193  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 883 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 883 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 894 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.57 
 
 		 884 aa  191  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 944 aa  190  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 873 aa  190  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2693  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 1006 aa  187  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 873 aa  187  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3032  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 874 aa  184  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 869 aa  184  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 897 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 907 aa  183  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 924 aa  182  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 952 aa  179  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  24.4 
 
 		 914 aa  178  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 901 aa  178  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  25.38 
 
 		 936 aa  177  7e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 975 aa  177  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  23.71 
 
 		 974 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 930 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>