29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6356 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6356  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1722  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1736  hypothetical protein  99.44 
 
 
205 aa  362  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.679061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5015  hypothetical protein  92.74 
 
 
201 aa  342  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.549407  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1644  hypothetical protein  90.5 
 
 
248 aa  337  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1644  hypothetical protein  89.39 
 
 
205 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1537  hypothetical protein  88.83 
 
 
205 aa  327  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.516137 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2268  shikimate kinase  80 
 
 
206 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2135  hypothetical protein  80 
 
 
206 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2079  hypothetical protein  80 
 
 
206 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0977  hypothetical protein  80 
 
 
180 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.518817  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2309  hypothetical protein  78.33 
 
 
206 aa  297  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1993  P-loop ATPase protein  72.88 
 
 
205 aa  275  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2267  P-loop ATPase protein  72.47 
 
 
205 aa  270  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1242  hypothetical protein  67.04 
 
 
222 aa  258  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0819  putative ATP-ase  64.6 
 
 
192 aa  218  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2638  putative ATP-ase  63.41 
 
 
192 aa  214  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0720  putative ATP-ase  40.61 
 
 
198 aa  140  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0245  hypothetical protein  37.98 
 
 
346 aa  87  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0250  hypothetical protein  37.9 
 
 
310 aa  84.3  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0087  hypothetical protein  36.15 
 
 
345 aa  75.1  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2639  P-loop ATPase  35 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.291525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2634  hypothetical protein  33.08 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0586  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883676  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4819  hypothetical protein  31.67 
 
 
202 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0904  hypothetical protein  32.26 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2484  hypothetical protein  33.06 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0210  hypothetical protein  27.74 
 
 
197 aa  51.6  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3695  hypothetical protein  34.59 
 
 
186 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>