280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6333 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3839  hypothetical protein  61.31 
 
 
567 aa  644    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.359472  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2117  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  79.71 
 
 
556 aa  848    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584922  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2173  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  79.71 
 
 
556 aa  848    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3588  hypothetical protein  67.45 
 
 
558 aa  742    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0889  hypothetical protein  61.64 
 
 
554 aa  667    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6238  hypothetical protein  69.57 
 
 
556 aa  732    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2303  hypothetical protein  79.28 
 
 
1496 aa  854    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5044  hypothetical protein  93.14 
 
 
555 aa  988    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2281  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  80.62 
 
 
556 aa  860    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.547695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00088  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  58.21 
 
 
557 aa  646    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1514  hypothetical protein  82.49 
 
 
555 aa  844    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18624  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1813  hypothetical protein  62.18 
 
 
554 aa  674    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0674  hypothetical protein  70.99 
 
 
551 aa  766    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0947  hypothetical protein  61.71 
 
 
554 aa  671    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1762  hypothetical protein  96.76 
 
 
556 aa  1030    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2373  hypothetical protein  67.75 
 
 
556 aa  720    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000294292  hitchhiker  0.0000289236 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6333  hypothetical protein  100 
 
 
556 aa  1119    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1667  hypothetical protein  89.25 
 
 
559 aa  939    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358711  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1670  hypothetical protein  89.61 
 
 
559 aa  954    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1746  hypothetical protein  100 
 
 
556 aa  1119    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529191  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4148  protein of unknown function DUF442  60.44 
 
 
557 aa  632  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0868  hypothetical protein  52.96 
 
 
539 aa  608  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.210326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0109  hypothetical protein  69.51 
 
 
417 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0079  hypothetical protein  70.54 
 
 
417 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0053  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  69.1 
 
 
422 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000634616 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0069  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  68.61 
 
 
422 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000464578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0069  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  68.61 
 
 
422 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0106574 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0072  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  70.42 
 
 
423 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245934  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5350  hypothetical protein  72.52 
 
 
396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.723811  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0378  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.93 
 
 
421 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3458  hypothetical protein  55.23 
 
 
414 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1682  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase class-II  58.81 
 
 
427 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0799  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.84 
 
 
413 aa  461  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34330  hypothetical protein  61.04 
 
 
411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00153013  normal  0.203445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2918  hypothetical protein  60.78 
 
 
411 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1542  putative transmembrane protein  58.14 
 
 
421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0588394 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.54 
 
 
418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2006  putative oxidoreductase  51.88 
 
 
418 aa  438  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113232  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1939  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.73 
 
 
425 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.746538  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2848  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  46.06 
 
 
422 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.815625  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2352  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.21 
 
 
395 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.128946  normal  0.129463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0045  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.97 
 
 
396 aa  361  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2576  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.34 
 
 
404 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581088  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3630  sulfide quinone oxidoreductase-like protein  44.61 
 
 
421 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.217473  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2915  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.81 
 
 
399 aa  349  8e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0078  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.79 
 
 
401 aa  348  1e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0075  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.14 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.14 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.23 
 
 
400 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438506  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1831  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.97 
 
 
400 aa  340  4e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.436589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.47 
 
 
399 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5690  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.47 
 
 
399 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.47 
 
 
399 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1961  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.45 
 
 
401 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209751  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3758  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.56 
 
 
426 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.379311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0986  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.64 
 
 
398 aa  333  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2891  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.44 
 
 
401 aa  333  7.000000000000001e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.71 
 
 
395 aa  324  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0708248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3633  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.77 
 
 
396 aa  317  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.315982 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2712  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.86 
 
 
400 aa  315  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.862127  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3524  hypothetical protein  37.66 
 
 
399 aa  302  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2337  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.81 
 
 
399 aa  301  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2551  hypothetical protein  38.4 
 
 
399 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.30285e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2276  hypothetical protein  38.15 
 
 
399 aa  298  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01825  conserved hypothetical protein  38.57 
 
 
487 aa  295  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.75293 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08346  conserved hypothetical protein  38.14 
 
 
442 aa  294  3e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1731  hypothetical protein  37.66 
 
 
399 aa  291  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000598467 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2360  hypothetical protein  37.16 
 
 
399 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.204751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2537  hypothetical protein  37.16 
 
 
399 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0495125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3042  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.91 
 
 
398 aa  278  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3237  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.6 
 
 
400 aa  277  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3958  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase-like protein  41.88 
 
 
372 aa  277  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.203323 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03140  Sulfide:quinone oxidoreductase, mitochondrial precursor, putative  37.04 
 
 
458 aa  260  6e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2318  hypothetical protein  37.8 
 
 
330 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000211189  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1298  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.93 
 
 
489 aa  243  5e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.53579  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.14 
 
 
456 aa  243  9e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169709  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.41 
 
 
449 aa  241  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.809961  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2082  twin-arginine translocation pathway signal  33.41 
 
 
491 aa  236  8e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2526  putative sulfide quinone-rductase  37.91 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.149353 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3497  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.75 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4021  hypothetical protein  37.22 
 
 
450 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1665  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.01 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2307  twin-arginine translocation pathway signal  35.1 
 
 
451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00993475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20580  NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit  32.08 
 
 
401 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.990825  normal  0.761376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.85 
 
 
438 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0928  twin-arginine translocation pathway signal  35.99 
 
 
436 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1051  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.12 
 
 
390 aa  201  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1034  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.75 
 
 
394 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0355  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.62 
 
 
403 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198305  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0365  sulfide-quinone reductase  31.62 
 
 
403 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0344  sulfide-quinone reductase  31.37 
 
 
403 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0624  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.3 
 
 
413 aa  143  9e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0441404 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0069  sulfide dehydrogenase, flavoprotein subunit, putative  27.74 
 
 
408 aa  137  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1203  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.79 
 
 
413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.223151  normal  0.0279723 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1846  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.12 
 
 
413 aa  134  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0223  oxidoreductase, putative  24.76 
 
 
413 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0099  sulfide dehydrogenase, flavoprotein subunit, putative  26.39 
 
 
408 aa  128  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5230  cysteine desulfurase  54.21 
 
 
501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.500122  normal  0.247226 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1554  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.89 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.138705 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1884  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.12 
 
 
408 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>