More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6002 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5381  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  92.18 
 
 		 473 aa  771    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0261986  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6002  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  100 
 
 		 473 aa  918    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  98.52 
 
 		 473 aa  907    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1980  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  87.1 
 
 		 468 aa  781    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2110  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  87.1 
 
 		 473 aa  786    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1206  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  86.68 
 
 		 468 aa  698    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187826 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2075  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 		 473 aa  918    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1653  cell cycle protein mesJ  69.92 
 
 		 489 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000820354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2678  cell cycle protein mesJ  69.7 
 
 		 492 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0688879  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2542  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  70.33 
 
 		 489 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2593  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  69.7 
 
 		 492 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1429  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  69.92 
 
 		 489 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431978  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3159  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  69.92 
 
 		 489 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.765148  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2156  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  69.92 
 
 		 489 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1944  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  70.42 
 
 		 494 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1629  PP family ATPase  65.34 
 
 		 476 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379742  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  64.26 
 
 		 481 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.14647  hitchhiker  0.00723394 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1387  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  65.19 
 
 		 472 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287685  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1105  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.77 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340413  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1011  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.19 
 
 		 472 aa  249  9e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.258759  normal  0.14023 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1249  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  42.96 
 
 		 425 aa  242  9e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1088  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  42.11 
 
 		 487 aa  236  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00200666  normal  0.0296865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1125  PP-loop  42.13 
 
 		 484 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00891393  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1170  putative cell cycle protein  43.5 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.791895 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0977  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.43 
 
 		 438 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1809  hypothetical protein  35.03 
 
 		 472 aa  219  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1178  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.84 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.509041  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1673  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.2 
 
 		 457 aa  215  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0475  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.96 
 
 		 449 aa  213  5.999999999999999e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1692  tRNA(Ile)-lysidine synthase  34.96 
 
 		 449 aa  213  7e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0861  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.93 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0263  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.94 
 
 		 430 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.144292 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0258  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.85 
 
 		 430 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.921604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0277  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.94 
 
 		 430 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1572  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.71 
 
 		 462 aa  206  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0258  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.94 
 
 		 430 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0274  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.62 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.433905  normal  0.237659 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2453  putative cell cycle protein  41.99 
 
 		 452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0589  cell cycle protein MesJ  40.14 
 
 		 445 aa  199  7.999999999999999e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0620316  normal  0.254248 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0934  cell-cycle protein  32.94 
 
 		 427 aa  199  9e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.504247  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0849  tRNA(Ile)-lysidine synthase  37.61 
 
 		 442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1237  GntR family transcriptional regulator  35.28 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2410  tRNA(Ile)-lysidine synthase  31.72 
 
 		 443 aa  186  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1163  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.48 
 
 		 427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114234  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4065  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.2 
 
 		 426 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000422892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0192  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.47 
 
 		 432 aa  183  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1360  PP-loop  38.26 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002764  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.51 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1266  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.86 
 
 		 464 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2619  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.89 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0850  hypothetical protein  33.09 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1805  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.49 
 
 		 439 aa  179  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.193318  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0181  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37 
 
 		 432 aa  179  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01389  cell cycle protein MesJ  32.39 
 
 		 441 aa  179  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.683525  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3415  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.47 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0726  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.85 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.238503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0190  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3147  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.12 
 
 		 442 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3472  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878016  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0199  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0959  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.47 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0198  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.3 
 
 		 431 aa  176  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00186  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.53 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.445968  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0825  hypothetical protein  31.88 
 
 		 431 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00185  hypothetical protein  36.53 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.434611  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3417  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.05 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1031  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.81 
 
 		 451 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3145  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.41 
 
 		 494 aa  172  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0165615 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03220  hypothetical protein  32.57 
 
 		 448 aa  170  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3265  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.33 
 
 		 470 aa  169  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.867953  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1084  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.81 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2861  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  38.17 
 
 		 326 aa  168  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1608  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.88 
 
 		 427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17280  hypothetical protein  35.38 
 
 		 442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2960  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.94 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2962  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.42 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2892  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.04 
 
 		 476 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3765  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.36 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000300868  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0918  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.63 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4169  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.73 
 
 		 427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2510  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.12 
 
 		 319 aa  163  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2869  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.55 
 
 		 469 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0103  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.67 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1834  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.25 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.05 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1842  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.67 
 
 		 445 aa  161  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.2555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1155  cell cycle protein MesJ  33.62 
 
 		 497 aa  161  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3036  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.87 
 
 		 440 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1466  Fis family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 476 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1551  cell cycle protein mesJ, putative  37.59 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1286  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.11 
 
 		 488 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.170507  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1263  PP-loop  30.35 
 
 		 420 aa  157  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1627  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.45 
 
 		 335 aa  158  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.45 
 
 		 335 aa  157  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.379803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1497  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.22 
 
 		 491 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1461  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.4 
 
 		 491 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0580  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  37.27 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0306545  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1364  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.6 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1289  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.77 
 
 		 436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38820  PP-loop-tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.58 
 
 		 435 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>