More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5900 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  90.24 
 
 
410 aa  669  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  100 
 
 
410 aa  791  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  91.71 
 
 
410 aa  689  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  100 
 
 
410 aa  791  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  98.54 
 
 
410 aa  782  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  96.59 
 
 
410 aa  744  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  92.68 
 
 
410 aa  693  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  63.48 
 
 
405 aa  447  1e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  63.98 
 
 
405 aa  447  1e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  60.31 
 
 
480 aa  418  1e-115  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  49.36 
 
 
403 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  51.55 
 
 
414 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  51.68 
 
 
407 aa  381  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  49.38 
 
 
425 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  51.28 
 
 
417 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  49.13 
 
 
406 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  48.77 
 
 
413 aa  364  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  50.65 
 
 
408 aa  364  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  49.23 
 
 
412 aa  362  5e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  48.32 
 
 
405 aa  357  2e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  48.32 
 
 
405 aa  357  3e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  47.47 
 
 
410 aa  355  8e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  49.61 
 
 
407 aa  353  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  47.15 
 
 
402 aa  348  9e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  50.39 
 
 
430 aa  346  5e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  49.74 
 
 
400 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  50.65 
 
 
408 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  51.94 
 
 
402 aa  340  3e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  48.32 
 
 
402 aa  340  3e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  48.06 
 
 
402 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  49.21 
 
 
400 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  50.53 
 
 
408 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  49.1 
 
 
402 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 
405 aa  331  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  48.69 
 
 
406 aa  328  1e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  44.7 
 
 
414 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  48.99 
 
 
528 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  49.2 
 
 
400 aa  326  4e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  49.74 
 
 
401 aa  325  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  51.42 
 
 
399 aa  325  9e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  41.33 
 
 
404 aa  323  5e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  41.25 
 
 
404 aa  322  6e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  41.6 
 
 
404 aa  320  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  50.26 
 
 
410 aa  320  4e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  46.75 
 
 
416 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  46.25 
 
 
416 aa  319  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  44.04 
 
 
436 aa  318  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  50.39 
 
 
399 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  49.12 
 
 
409 aa  316  5e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  41.93 
 
 
406 aa  313  3e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  48.03 
 
 
409 aa  313  3e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  42.35 
 
 
412 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  44.61 
 
 
417 aa  310  3e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  41.98 
 
 
412 aa  302  8e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  47.49 
 
 
417 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  47.49 
 
 
417 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  47.49 
 
 
417 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  47.24 
 
 
398 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  47.49 
 
 
417 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  47.49 
 
 
417 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  47.49 
 
 
417 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  48.17 
 
 
414 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  43.01 
 
 
411 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  41.71 
 
 
413 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 
411 aa  284  2e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  41.45 
 
 
411 aa  282  6e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  39.15 
 
 
421 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  39.9 
 
 
433 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  39.15 
 
 
412 aa  266  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  38.9 
 
 
412 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  38.87 
 
 
405 aa  249  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  37.05 
 
 
415 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  35.37 
 
 
412 aa  246  5e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  37.01 
 
 
414 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  37.1 
 
 
411 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  37.59 
 
 
403 aa  226  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  39.04 
 
 
415 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  40.94 
 
 
421 aa  217  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  38.68 
 
 
412 aa  215  1e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  37.53 
 
 
427 aa  210  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  36.55 
 
 
389 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  35.75 
 
 
411 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 
433 aa  141  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  31.73 
 
 
422 aa  136  6e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  30.05 
 
 
414 aa  132  8e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
442 aa  131  2e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 
405 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  1.8384e-11 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
438 aa  129  1e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  2.15921e-06  hitchhiker  5.49805e-05 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  29.68 
 
 
428 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 
431 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  29.82 
 
 
431 aa  126  8e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  30.68 
 
 
427 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
431 aa  122  1e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 
430 aa  121  2e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  26.51 
 
 
430 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  26.95 
 
 
452 aa  118  2e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 
424 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  27.38 
 
 
442 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
452 aa  117  4e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  27.16 
 
 
430 aa  115  1e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>