More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5888 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2107  Na+/solute symporter  95.98 
 
 		 671 aa  1212    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911895  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  61.72 
 
 		 688 aa  794    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  61.48 
 
 		 687 aa  798    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  89.12 
 
 		 671 aa  1146    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  61.98 
 
 		 687 aa  801    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  63.15 
 
 		 683 aa  800    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  52.51 
 
 		 713 aa  645    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  89.27 
 
 		 807 aa  1145    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5518  Na+/solute symporter  98.36 
 
 		 671 aa  1323    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  82.39 
 
 		 672 aa  1056    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  89.12 
 
 		 671 aa  1146    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2214  Na+/solute symporter  99.7 
 
 		 671 aa  1339    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1087  Na+/solute symporter  94.78 
 
 		 671 aa  1193    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  89.87 
 
 		 671 aa  1160    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  89.27 
 
 		 671 aa  1151    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  53.19 
 
 		 705 aa  651    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  82.99 
 
 		 672 aa  1063    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  63.15 
 
 		 683 aa  808    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5888  Na+/solute symporter  100 
 
 		 671 aa  1345    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  89.12 
 
 		 671 aa  1146    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2228  Na+/solute symporter  95.83 
 
 		 671 aa  1211    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2189  Na+/solute symporter  100 
 
 		 671 aa  1345    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  89.27 
 
 		 671 aa  1149    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  89.12 
 
 		 671 aa  1146    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  80.45 
 
 		 672 aa  1053    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  55.84 
 
 		 681 aa  691    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  51.84 
 
 		 703 aa  630  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  49.85 
 
 		 703 aa  622  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  51.15 
 
 		 678 aa  609  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  51.92 
 
 		 726 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5062  Na+/solute symporter  51.18 
 
 		 699 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2052  Na+/solute symporter  51.33 
 
 		 702 aa  604  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.324787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  50.6 
 
 		 699 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2192  Na+/solute symporter  51.19 
 
 		 769 aa  559  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  45.68 
 
 		 637 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2877  Na+/solute symporter  50.45 
 
 		 695 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.81009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2364  Calcium-binding EF-hand-containing protein  50.36 
 
 		 695 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  40.81 
 
 		 722 aa  502  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1384  Na+/solute symporter  48.86 
 
 		 676 aa  498  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.604499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  40.41 
 
 		 722 aa  472  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  40.38 
 
 		 719 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  51.81 
 
 		 614 aa  240  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  42.86 
 
 		 729 aa  238  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  50.66 
 
 		 759 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  48.28 
 
 		 760 aa  226  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  43.59 
 
 		 558 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  40.25 
 
 		 593 aa  189  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  39.34 
 
 		 572 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  26.51 
 
 		 693 aa  187  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  36.08 
 
 		 573 aa  187  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  38.93 
 
 		 572 aa  187  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  38.64 
 
 		 578 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  39.34 
 
 		 572 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  43 
 
 		 567 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  38.17 
 
 		 578 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  37.65 
 
 		 575 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  38.93 
 
 		 572 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  44.12 
 
 		 572 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  38.93 
 
 		 572 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  40 
 
 		 582 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  37.35 
 
 		 578 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  37.35 
 
 		 578 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  37.35 
 
 		 578 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  37.35 
 
 		 578 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  37.79 
 
 		 578 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  37.4 
 
 		 578 aa  182  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  37.79 
 
 		 578 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  36.42 
 
 		 566 aa  182  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  41.94 
 
 		 572 aa  182  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  35.95 
 
 		 586 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  36.47 
 
 		 591 aa  182  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  37.34 
 
 		 568 aa  181  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  45.85 
 
 		 590 aa  181  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  39.6 
 
 		 582 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  40 
 
 		 582 aa  181  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  44.12 
 
 		 594 aa  181  4.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  44.12 
 
 		 594 aa  179  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  37.35 
 
 		 567 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.5 
 
 		 560 aa  179  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  46 
 
 		 589 aa  176  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  33.52 
 
 		 593 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  48.56 
 
 		 619 aa  175  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  48.21 
 
 		 551 aa  174  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  42.03 
 
 		 618 aa  174  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  46.63 
 
 		 559 aa  174  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  39.74 
 
 		 603 aa  174  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  31.82 
 
 		 592 aa  173  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  41.67 
 
 		 604 aa  172  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  43.54 
 
 		 591 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  43.78 
 
 		 622 aa  171  6e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  43.96 
 
 		 609 aa  170  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  38.11 
 
 		 589 aa  170  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  39.13 
 
 		 596 aa  167  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  44.33 
 
 		 588 aa  166  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  42.79 
 
 		 622 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  28.66 
 
 		 591 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  42.79 
 
 		 622 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  35.87 
 
 		 563 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  42.29 
 
 		 589 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  34.24 
 
 		 548 aa  165  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>