93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5822 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
163 aa  331  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
163 aa  331  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  95.3 
 
 
163 aa  293  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  97.55 
 
 
163 aa  288  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  95.09 
 
 
163 aa  279  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  93.87 
 
 
163 aa  278  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  87.12 
 
 
193 aa  261  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  86.5 
 
 
163 aa  244  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  72.84 
 
 
165 aa  225  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  72.84 
 
 
165 aa  225  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  69.33 
 
 
166 aa  216  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  70.37 
 
 
166 aa  216  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  68.1 
 
 
194 aa  209  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  66.46 
 
 
174 aa  192  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  57.32 
 
 
161 aa  186  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  55.28 
 
 
162 aa  160  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  57.24 
 
 
162 aa  140  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  43.21 
 
 
154 aa  120  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  42.33 
 
 
153 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  39.75 
 
 
151 aa  106  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  38.32 
 
 
153 aa  104  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  38.41 
 
 
154 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  39.02 
 
 
154 aa  101  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  39.38 
 
 
150 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  39.13 
 
 
150 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  39.38 
 
 
150 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  41.72 
 
 
154 aa  94.7  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  40.36 
 
 
150 aa  94  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  40 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  38.18 
 
 
153 aa  90.9  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  41.6 
 
 
157 aa  89.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  41.6 
 
 
151 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  30.3 
 
 
153 aa  87.4  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  41.03 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  35.19 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  33.74 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  36.48 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  35.22 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  33.12 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  38.98 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  29.55 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00380  TrpR binding protein WrbA  32.63 
 
 
198 aa  57.8  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  31.58 
 
 
200 aa  54.3  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  31.58 
 
 
200 aa  54.3  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.14 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  32.63 
 
 
203 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 
200 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  35.16 
 
 
120 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  27.84 
 
 
204 aa  47.4  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  32.98 
 
 
203 aa  47.4  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0482  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.8 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000255007  decreased coverage  0.000283878 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  30.43 
 
 
206 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  27.84 
 
 
204 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  27.37 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  26.6 
 
 
200 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 
198 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 
198 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 
198 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 
198 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 
198 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  36.59 
 
 
213 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  26.32 
 
 
200 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 
199 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 
199 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  27.37 
 
 
199 aa  45.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 
199 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  34.67 
 
 
195 aa  45.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1414  hypothetical protein  28.81 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201843  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0330  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.87 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  31.87 
 
 
82 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  25.26 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  25.26 
 
 
200 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 
199 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  30.85 
 
 
198 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  30.85 
 
 
203 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  25.26 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 
199 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  27.66 
 
 
200 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3178  flavoprotein WrbA  34.04 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  28.72 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.2 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2222  flavoprotein WrbA  27.17 
 
 
203 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
186 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  24.21 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  27.66 
 
 
199 aa  42  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  28.26 
 
 
206 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0608  TrpR binding protein WrbA  30.53 
 
 
198 aa  42  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  33.75 
 
 
86 aa  41.6  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  25.26 
 
 
200 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2648  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.03 
 
 
144 aa  41.2  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000348313  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  34.67 
 
 
188 aa  41.2  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  26.6 
 
 
198 aa  40.8  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1251  flavoprotein WrbA  31.58 
 
 
206 aa  40.8  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>