More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5776 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  82.35 
 
 		 430 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  95.38 
 
 		 390 aa  704    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  100 
 
 		 390 aa  767    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  93.59 
 
 		 390 aa  728    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  82.35 
 
 		 430 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  82.35 
 
 		 430 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  98.97 
 
 		 390 aa  759    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  90.77 
 
 		 390 aa  685    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  93.08 
 
 		 390 aa  724    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  100 
 
 		 390 aa  767    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  82.1 
 
 		 390 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  82.1 
 
 		 430 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  82.1 
 
 		 430 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  82.1 
 
 		 430 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  59.24 
 
 		 387 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  59.74 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  54.34 
 
 		 389 aa  411  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  58.97 
 
 		 386 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  57.97 
 
 		 384 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  57.97 
 
 		 430 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  57.97 
 
 		 384 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  56.27 
 
 		 386 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  57.97 
 
 		 430 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  57.97 
 
 		 411 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  57.97 
 
 		 384 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  56.27 
 
 		 386 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  55.75 
 
 		 386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  57.97 
 
 		 384 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  55.75 
 
 		 386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  56.01 
 
 		 386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  57.92 
 
 		 388 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  55.67 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  57.45 
 
 		 385 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  54.48 
 
 		 386 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  56.64 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  57.18 
 
 		 385 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  56 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  57.99 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  55.19 
 
 		 386 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  57.72 
 
 		 385 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  57.99 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  56.6 
 
 		 523 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  53.57 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  51.13 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  53.57 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  50.38 
 
 		 386 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  53.32 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  51.44 
 
 		 404 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  53.24 
 
 		 376 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  49.63 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  49.63 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  49.63 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  49.63 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  52.17 
 
 		 386 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  49.38 
 
 		 399 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  49.87 
 
 		 391 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  50.26 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  50.26 
 
 		 386 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  50.95 
 
 		 386 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  50.95 
 
 		 386 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  47.26 
 
 		 421 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  47.26 
 
 		 421 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  48.1 
 
 		 397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  48.09 
 
 		 397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  46.82 
 
 		 397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  48.48 
 
 		 389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  48.01 
 
 		 445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  46.82 
 
 		 397 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  47.72 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  48.08 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  48.08 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  48.59 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  48.34 
 
 		 436 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  48.34 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  48.34 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  48.34 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  48.34 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  48.34 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  48.08 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  47.33 
 
 		 383 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  47.56 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  47.3 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  47.3 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  47.87 
 
 		 391 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  46.55 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  46.04 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  48.47 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  43.41 
 
 		 389 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  45.07 
 
 		 384 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  43.44 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  43.59 
 
 		 395 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  43.59 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  43.56 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5188  porin  43.6 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  44.33 
 
 		 383 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  44.12 
 
 		 386 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0452  porin  48.81 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  44.54 
 
 		 398 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  42.82 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  44.99 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>