264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5675 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5675  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  100 
 
 
210 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6039  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  100 
 
 
210 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126863 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  96.67 
 
 
210 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152148 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7470  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  87.62 
 
 
210 aa  384  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0105  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  56.54 
 
 
222 aa  227  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4826  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.74 
 
 
210 aa  188  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5382  acyl carrier protein phosphodiesterase, putative  42.55 
 
 
209 aa  166  3e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0754  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.67 
 
 
207 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665769  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  39.62 
 
 
209 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1236  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.06 
 
 
210 aa  130  1e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1846  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.72 
 
 
208 aa  124  8e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0747958  normal  0.1639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2250  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.92 
 
 
210 aa  119  2e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.488549  normal  0.224551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4802  putative (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase (ACP phosphodiesterase)  34.36 
 
 
208 aa  119  5e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3492  azoreductase  34.42 
 
 
212 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2351  azoreductase  34.88 
 
 
211 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.7557e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2064  azoreductase  34.42 
 
 
211 aa  108  4e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  2.03481e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2222  azoreductase  34.88 
 
 
211 aa  108  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.66234e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2023  azoreductase  34.42 
 
 
211 aa  107  9e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.34094e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1788  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.98 
 
 
208 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2239  azoreductase  33.95 
 
 
211 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.868e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2085  azoreductase  33.95 
 
 
211 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.56385e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2266  azoreductase  33.95 
 
 
211 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42446e-33 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2025  azoreductase  33.95 
 
 
211 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.08402e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2269  azoreductase  33.95 
 
 
211 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  6.07817e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1642  azoreductase  33.49 
 
 
211 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.15875e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0196  azoreductase  30.66 
 
 
208 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0203281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5262  azoreductase  31.6 
 
 
208 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000325638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1478  azoreductase  31.02 
 
 
230 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5590  azoreductase  31.6 
 
 
208 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5505  azoreductase  31.6 
 
 
208 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0202  azoreductase  30.66 
 
 
208 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5090  azoreductase  31.6 
 
 
208 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5660  azoreductase  31.6 
 
 
208 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.883174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3102  azoreductase  33.49 
 
 
211 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  5.46627e-10  hitchhiker  2.39048e-14 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1914  azoreductase  32.02 
 
 
230 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000230252  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.69 
 
 
207 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  2.37921e-06 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1944  azoreductase  32.02 
 
 
230 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49606e-30 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1728  azoreductase  32.02 
 
 
208 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.41266e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3430  azoreductase  32.02 
 
 
230 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  5.41097e-10  hitchhiker  2.34591e-08 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1750  azoreductase  32.02 
 
 
208 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24715e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5107  azoreductase  32.08 
 
 
208 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0384145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1993  azoreductase  32.02 
 
 
208 aa  101  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  7.76561e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1908  azoreductase  32.02 
 
 
208 aa  101  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  3.51554e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1770  azoreductase  32.02 
 
 
230 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.43182e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5539  azoreductase  31.13 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5418  azoreductase  31.13 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5534  azoreductase  31.13 
 
 
208 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5204  azoreductase  30.66 
 
 
208 aa  98.2  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0927  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.19 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1772  azoreductase  29.17 
 
 
230 aa  95.9  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.56707e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.94 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.94 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  29.27 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  29.84 
 
 
201 aa  92.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.8 
 
 
232 aa  91.7  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  28.78 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  29.84 
 
 
201 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  29.84 
 
 
201 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  29.84 
 
 
201 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  28.78 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  30.89 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  33.86 
 
 
211 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  29.32 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  29.32 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  32.64 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  28.78 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  28.78 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  29.32 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  28.78 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  29.32 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  29.32 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  28.78 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.78 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  29.32 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  28.78 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  5.99695e-06 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  28.78 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  30.37 
 
 
201 aa  89  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.25 
 
 
198 aa  89  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  29.27 
 
 
201 aa  89  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0793  flavodoxin family protein  27.36 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0777  acyl carrier protein phosphodiesterase  27.36 
 
 
198 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.22 
 
 
199 aa  85.5  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.37 
 
 
213 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  8.9212e-06  hitchhiker  7.0742e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  29.84 
 
 
213 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.57 
 
 
198 aa  84.7  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  29.84 
 
 
198 aa  84.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.84 
 
 
198 aa  84.3  1e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.05 
 
 
203 aa  84.3  1e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  28.8 
 
 
201 aa  84  1e-15  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  29.84 
 
 
197 aa  84.7  1e-15  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.53 
 
 
203 aa  84  1e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0988  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.78 
 
 
198 aa  83.2  2e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  1.05649e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  28.92 
 
 
196 aa  83.2  2e-15  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
203 aa  83.6  2e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28 
 
 
207 aa  83.2  3e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.37 
 
 
199 aa  83.2  3e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.05 
 
 
198 aa  83.2  3e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.05 
 
 
198 aa  83.2  3e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1069  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.3 
 
 
201 aa  83.2  3e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0133696  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.05 
 
 
198 aa  83.2  3e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>