255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5615 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  77 
 
 		 200 aa  323  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 204 aa  94.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 216 aa  92  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  34.43 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 248 aa  78.2  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 383 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  34.01 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  30.63 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  29.76 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  32.65 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  30.12 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  29.57 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  31.29 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  43.18 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  34.15 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4883  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00152311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  30.67 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 191 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  38.38 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  29.08 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>