79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5589 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  327  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  327  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  98.73 
 
 
157 aa  324  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  82.89 
 
 
152 aa  269  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  81.82 
 
 
182 aa  265  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  75.5 
 
 
152 aa  247  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  78.57 
 
 
140 aa  243  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  71.72 
 
 
155 aa  222  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  66.23 
 
 
156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  69.57 
 
 
143 aa  209  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  70.5 
 
 
205 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  70.5 
 
 
205 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  70.5 
 
 
205 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  70.5 
 
 
205 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  70.5 
 
 
205 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  70.29 
 
 
142 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  69.06 
 
 
142 aa  200  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  58.44 
 
 
297 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  65.12 
 
 
128 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  56 
 
 
150 aa  175  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  53.79 
 
 
288 aa  174  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  55.03 
 
 
287 aa  172  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  51.66 
 
 
271 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  50.99 
 
 
271 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  52.7 
 
 
276 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  52.35 
 
 
285 aa  163  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  51.01 
 
 
285 aa  163  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  52.38 
 
 
273 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  51.35 
 
 
276 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  53.42 
 
 
281 aa  160  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  53.42 
 
 
281 aa  160  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  51.02 
 
 
275 aa  160  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  48.34 
 
 
272 aa  159  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  49.32 
 
 
276 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  51.02 
 
 
276 aa  158  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  49.32 
 
 
276 aa  157  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  48.68 
 
 
272 aa  156  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  49.32 
 
 
276 aa  155  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  52.05 
 
 
277 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  48.98 
 
 
276 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  49.32 
 
 
276 aa  154  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  51.08 
 
 
144 aa  141  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  41.43 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  34.31 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  35.82 
 
 
325 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  38.3 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  33.33 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  33.83 
 
 
324 aa  79  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  34.81 
 
 
325 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  34.81 
 
 
303 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  34.81 
 
 
325 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  34.81 
 
 
331 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  34.81 
 
 
325 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  34.81 
 
 
303 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  34.81 
 
 
273 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  35.07 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  35.37 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  34.07 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  33.8 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  34.78 
 
 
328 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  33.83 
 
 
320 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  33.83 
 
 
320 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  29.88 
 
 
363 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  33.08 
 
 
324 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  34.33 
 
 
335 aa  75.1  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  31.34 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  30.3 
 
 
332 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  32.84 
 
 
312 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  31.58 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2449  hypothetical protein  55.36 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.941698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  31.58 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  28.68 
 
 
316 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  30.5 
 
 
320 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  30.5 
 
 
320 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  30.43 
 
 
323 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  30.66 
 
 
320 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  27.82 
 
 
313 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  28.57 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  31.97 
 
 
323 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.908609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>