259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5562 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_5927  ABC transport system substrate-binding protein  100 
 
 
340 aa  679  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6433  ABC transport system substrate-binding protein  98.53 
 
 
340 aa  670  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5562  ABC transport system substrate-binding protein  100 
 
 
340 aa  679  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1377  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  83.5 
 
 
329 aa  534  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358866  hitchhiker  0.00572107 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5234  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  84.51 
 
 
361 aa  516  1e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1859  ABC transport system substrate-binding protein  64.6 
 
 
330 aa  428  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4025  ABC transport system substrate-binding protein  62.35 
 
 
336 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3730  ABC transport system substrate-binding protein  62.35 
 
 
336 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.201225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3908  ABC transport system substrate-binding protein  64.36 
 
 
336 aa  404  1e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.074485  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0790  NlpA lipoprotein  59.82 
 
 
327 aa  404  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0081  ABC transport system substrate-binding protein  64.47 
 
 
332 aa  398  1e-110  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1800  NLPA lipoprotein  58.86 
 
 
325 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3081  NMT1/THI5 like domain protein  57.06 
 
 
326 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0041  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.71 
 
 
338 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.487407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  37.54 
 
 
339 aa  165  1e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1079  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  30.12 
 
 
333 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0298231  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3256  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  31.6 
 
 
383 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0057  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  30.67 
 
 
341 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4454  ABC transporter periplasmic binding protein, urea carboxylase region  35.97 
 
 
369 aa  117  4e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0612  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.33 
 
 
360 aa  116  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0367247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0066  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  29.81 
 
 
316 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  28.48 
 
 
326 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.193725  normal  0.38818 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.01 
 
 
347 aa  112  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1122  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.05 
 
 
350 aa  110  4e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0050  ABC transporter periplasmic binding protein, urea carboxylase region  31.62 
 
 
351 aa  109  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2601  ABC transporter periplasmic binding protein, urea carboxylase region  30.6 
 
 
357 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3492  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic components  31 
 
 
360 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2183  putative taurine transport system protein  32.08 
 
 
356 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1593  ABC transporter periplasmic binding protein, urea carboxylase region  30 
 
 
356 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61246  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3974  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.9 
 
 
372 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916208  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3789  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  26.79 
 
 
320 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1887  putative transport protein  31.42 
 
 
359 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.273004  normal  0.972689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0739  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.72 
 
 
356 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14895  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0403  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  28.96 
 
 
328 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4767  NlpA lipoprotein  27.57 
 
 
348 aa  103  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2732  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.95 
 
 
359 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0412879  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2561  NLPA lipoprotein  29.8 
 
 
339 aa  102  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.79068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2399  ABC transporter periplasmic binding protein, urea carboxylase region  31.5 
 
 
352 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4536  NLPA lipoprotein  30.94 
 
 
373 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4238  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.53 
 
 
355 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31178  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2686  ABC transporter periplasmic binding protein, urea carboxylase region  29.69 
 
 
352 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.993607  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1241  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.91 
 
 
360 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.944959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1227  NLPA lipoprotein  31.19 
 
 
367 aa  96.3  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2497  possible taurine transport system protein  29.41 
 
 
357 aa  96.3  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3972  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.14 
 
 
355 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122689  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1361  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.02 
 
 
355 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  normal  0.0792191 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.19 
 
 
318 aa  94  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1343  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.09 
 
 
355 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43971  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0291  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  25.18 
 
 
320 aa  92.8  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  8.06858e-06 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3202  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.46 
 
 
346 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5003  NMT1/THI5 like domain protein  29.03 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6522  ABC transporter periplasmic binding protein, urea carboxylase region  28.64 
 
 
357 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.533872 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6110  ABC transporter periplasmic binding protein, urea carboxylase region  27.7 
 
 
357 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.876709 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1366  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.88 
 
 
353 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.0219132 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3665  substrate-binding protein involved in ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  24.76 
 
 
318 aa  85.9  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1647  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  22.46 
 
 
324 aa  84  4e-15  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2356  sulfonate ABC transporter periplasmic-binding protein  30.09 
 
 
378 aa  83.6  4e-15  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.477529  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1088  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  27.24 
 
 
329 aa  82  1e-14  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212665  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1989  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter  27.31 
 
 
339 aa  82.4  1e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.553257  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2535  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  25.82 
 
 
333 aa  80.9  3e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4931  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  24.03 
 
 
325 aa  80.1  6e-14  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4500  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  31.05 
 
 
348 aa  78.6  2e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3527  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter protein  25.91 
 
 
328 aa  76.3  6e-13  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.304801  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6160  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.55 
 
 
343 aa  70.9  3e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.419436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4332  hypothetical protein  83.72 
 
 
120 aa  69.3  8e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.986651  normal  0.0170834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3016  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  28.85 
 
 
351 aa  68.9  1e-10  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4091  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.88 
 
 
387 aa  66.6  6e-10  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00248715  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0325  NMT1/THI5 like domain protein  25.17 
 
 
313 aa  64.7  2e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6455  ABC transporter substrate-binding protein  26.27 
 
 
314 aa  63.9  4e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.871345  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2645  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.61 
 
 
320 aa  63.5  4e-09  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1430  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.02 
 
 
314 aa  62.4  1e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1186  taurine ABC transporter, taurine-binding protein  26.67 
 
 
319 aa  61.2  3e-08  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.217841  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5086  OmpA/MotB domain protein  27.87 
 
 
533 aa  60.8  3e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0449  NMT1/THI5 like domain protein  26.99 
 
 
327 aa  60.8  3e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1089  taurine ABC transporter, taurine-binding protein  26.67 
 
 
319 aa  61.2  3e-08  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1047  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 
322 aa  60.8  4e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1817  putative lipoprotein  26.09 
 
 
297 aa  59.7  7e-08  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2720  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 
325 aa  59.7  8e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1483  ABC transporter substrate-binding protein  31.12 
 
 
330 aa  59.3  9e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.4 
 
 
326 aa  58.9  1e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.302787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1212  NMT1/THI5 like domain protein  30.67 
 
 
326 aa  58.5  1e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0153956  normal  0.631224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1423  extracellular solute-binding protein family 3  26.4 
 
 
326 aa  58.9  1e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2859  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.3 
 
 
317 aa  58.9  1e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23743  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0406  NMT1/THI5 like domain protein  27.66 
 
 
334 aa  58.2  2e-07  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0154  extracellular solute-binding protein, family 3  25.93 
 
 
323 aa  57  5e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2496  hypothetical protein  35.65 
 
 
382 aa  56.6  6e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4052  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.19 
 
 
354 aa  55.5  1e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3641  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 
319 aa  55.8  1e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0351893  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.74 
 
 
322 aa  54.7  2e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2620  NMT1/THI5 like domain protein  26.88 
 
 
328 aa  55.1  2e-06  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.985405  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1109  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.29 
 
 
338 aa  55.1  2e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5823  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.14 
 
 
326 aa  54.7  2e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  hitchhiker  0.00768111 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0833  ABC transporter, substrate binding protein  31.01 
 
 
335 aa  54.3  3e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3874  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.76 
 
 
343 aa  53.9  4e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2277  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.41 
 
 
313 aa  53.9  4e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191617  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  28.27 
 
 
311 aa  53.5  5e-06  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  30.29 
 
 
335 aa  53.5  5e-06  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0145  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.74 
 
 
324 aa  53.1  6e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.156269 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0405  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  30 
 
 
331 aa  53.1  6e-06  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2621  NMT1/THI5 like domain protein  26.55 
 
 
330 aa  53.1  6e-06  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>