154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5559 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  97.71 
 
 
218 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  82.57 
 
 
218 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  82.11 
 
 
218 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  71.01 
 
 
214 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  68.84 
 
 
215 aa  311  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  66.98 
 
 
211 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  67.61 
 
 
213 aa  305  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  64.49 
 
 
214 aa  305  3e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  66.98 
 
 
211 aa  305  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  65.9 
 
 
216 aa  302  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  66.36 
 
 
217 aa  301  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  65.42 
 
 
232 aa  300  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  64.19 
 
 
211 aa  297  9e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  66.67 
 
 
211 aa  297  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  65.09 
 
 
219 aa  295  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  68.66 
 
 
205 aa  289  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  68.66 
 
 
205 aa  287  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  64.95 
 
 
212 aa  285  4e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  63.21 
 
 
229 aa  279  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  68.21 
 
 
212 aa  279  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  63.51 
 
 
235 aa  275  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  56.22 
 
 
211 aa  262  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  59.81 
 
 
211 aa  261  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  61.31 
 
 
217 aa  253  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  59.62 
 
 
210 aa  249  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  55.98 
 
 
214 aa  246  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  53.55 
 
 
216 aa  245  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  52.66 
 
 
216 aa  241  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  52.4 
 
 
216 aa  241  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  51.67 
 
 
216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  56.16 
 
 
208 aa  238  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  57.71 
 
 
211 aa  237  9e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  69.14 
 
 
179 aa  236  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  53.43 
 
 
214 aa  232  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  52.43 
 
 
206 aa  230  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  52.43 
 
 
206 aa  230  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  53.17 
 
 
211 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  52.94 
 
 
211 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  54.63 
 
 
202 aa  228  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  54.55 
 
 
212 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  49.77 
 
 
221 aa  211  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  50.24 
 
 
223 aa  211  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  53 
 
 
199 aa  209  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  49.28 
 
 
214 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  49.28 
 
 
214 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  49.28 
 
 
214 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  46.8 
 
 
224 aa  192  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  47.37 
 
 
238 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  36.67 
 
 
243 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  36.54 
 
 
251 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  36.06 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  36.41 
 
 
244 aa  131  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  36.79 
 
 
244 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  34.62 
 
 
270 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  36.76 
 
 
207 aa  121  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  34.6 
 
 
278 aa  116  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  32.38 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  34.29 
 
 
270 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  30.77 
 
 
245 aa  112  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  34.29 
 
 
275 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  31.55 
 
 
274 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  33.81 
 
 
269 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  33.17 
 
 
251 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  33.17 
 
 
251 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  33.17 
 
 
274 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  30.95 
 
 
279 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  34.69 
 
 
273 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  32.69 
 
 
251 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  35 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  34.74 
 
 
280 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  36.02 
 
 
204 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  32.35 
 
 
243 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  34.18 
 
 
273 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  32.84 
 
 
270 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  32.38 
 
 
242 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  32.38 
 
 
270 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  34.18 
 
 
245 aa  102  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  33.51 
 
 
248 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  30.39 
 
 
280 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  30.56 
 
 
257 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  34.8 
 
 
237 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  34.8 
 
 
237 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  34.8 
 
 
237 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  32.14 
 
 
235 aa  98.2  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  33.16 
 
 
241 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  32.97 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  33.01 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  30.56 
 
 
277 aa  95.5  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  31.05 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  31.58 
 
 
283 aa  94.4  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  36.26 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  36.26 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  31.94 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  30.62 
 
 
244 aa  92.4  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  31.41 
 
 
241 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  29.7 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  30.16 
 
 
307 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  29.63 
 
 
287 aa  89.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>