49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5553 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5553  regulatory protein, LysR  100 
 
 		 114 aa  235  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5918  regulatory protein, LysR  99.12 
 
 		 114 aa  233  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6422  LysR family transcriptional regulator  95.61 
 
 		 307 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5540  LysR family transcriptional regulator  80.18 
 
 		 313 aa  186  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6997  LysR family transcriptional regulator  73.68 
 
 		 321 aa  181  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5866  transcriptional regulator, LysR family  80.39 
 
 		 315 aa  174  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1130  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  56.73 
 
 		 302 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2045  transcriptional regulator, LysR family  44.44 
 
 		 307 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1726  LysR substrate-binding  44.44 
 
 		 307 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1088  transcriptional regulator, LysR family  45.57 
 
 		 307 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0130625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3401  LysR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.674925  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3204  transcriptional regulator, LysR family  46.15 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.340375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3125  LysR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1996  transcriptional regulator, LysR family  46.48 
 
 		 296 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1677  LysR substrate-binding  46.48 
 
 		 296 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1639  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.286177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2659  LysR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4296  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0504  LysR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3742  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 301 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.927612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1043  LysR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 309 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5229  LysR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2324  LysR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 306 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1604  transcriptional regulator, LysR family  36.62 
 
 		 322 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4762  transcriptional regulator, LysR family  40.91 
 
 		 301 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0760  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 299 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1214  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 299 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1241  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 299 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1734  transcriptional regulator, LysR family  43.75 
 
 		 341 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7442  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 307 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2823  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 299 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1907  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 298 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1724  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 296 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50160  LysR family transcriptional regulator protein  32.99 
 
 		 300 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2966  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 300 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1683  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1428  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 322 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1535  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 		 299 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2841  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 299 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0545664  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2021  LysR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 299 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1689  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1614  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2973  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 297 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1776  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 283 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4563  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0057  hypothetical protein  35.56 
 
 		 302 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5292  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 306 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  0.585021 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1852  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 301 aa  40.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2728  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 304 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>