More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5526 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  97.41 
 
 		 193 aa  350  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  87.5 
 
 		 193 aa  342  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  81.73 
 
 		 209 aa  338  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  81.25 
 
 		 209 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  77.51 
 
 		 209 aa  331  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  81.82 
 
 		 209 aa  298  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 215 aa  138  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 193 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 193 aa  92  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  34.57 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  32.8 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  27.47 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  32.02 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  29.12 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  32.46 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
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NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  29.1 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  28.26 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1242  transcriptional regulator, TetR-family  26.02 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
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NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  30.09 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  28.66 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
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NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
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NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
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NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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