109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5515 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  100 
 
 
422 aa  854    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  100 
 
 
422 aa  854    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  98.58 
 
 
422 aa  845    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  35.16 
 
 
427 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.67 
 
 
424 aa  206  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  29.85 
 
 
414 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  29.85 
 
 
414 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  29.85 
 
 
414 aa  189  7e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  29.66 
 
 
414 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0416  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.99 
 
 
726 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147603  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2432  hypothetical protein  28.85 
 
 
430 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.42 
 
 
541 aa  157  4e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  28.93 
 
 
1033 aa  149  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  27.8 
 
 
410 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  27.38 
 
 
410 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.81 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  31.21 
 
 
420 aa  133  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  30.81 
 
 
575 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  23.21 
 
 
410 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.78 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.83 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  26.77 
 
 
924 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  28.11 
 
 
900 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  25 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  28.11 
 
 
914 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  28.11 
 
 
900 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  29.86 
 
 
756 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  25.82 
 
 
912 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  26.07 
 
 
891 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  26.28 
 
 
904 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  26.3 
 
 
926 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  25.98 
 
 
904 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  26.96 
 
 
894 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  23.64 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  25 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  27.49 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  27.76 
 
 
896 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.45 
 
 
432 aa  64.3  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  24.21 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.86 
 
 
418 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.98 
 
 
723 aa  60.8  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.5 
 
 
410 aa  60.8  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  28.36 
 
 
399 aa  60.1  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  22.98 
 
 
399 aa  58.9  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.52 
 
 
410 aa  58.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  23.32 
 
 
405 aa  57  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.78 
 
 
405 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  23.22 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  23.49 
 
 
453 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  23.49 
 
 
453 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.04 
 
 
416 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  24.55 
 
 
411 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.23 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  25.12 
 
 
425 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  23.68 
 
 
437 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  24.58 
 
 
436 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  25.41 
 
 
403 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  27.9 
 
 
424 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  27.04 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  30.32 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  25.15 
 
 
409 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.81 
 
 
403 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.81 
 
 
403 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  29.81 
 
 
411 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  28.1 
 
 
430 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  27.52 
 
 
410 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  24.15 
 
 
405 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  23.02 
 
 
409 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1347  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.33 
 
 
417 aa  50.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.207795  normal  0.112273 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  25.2 
 
 
406 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  25.2 
 
 
406 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  26.88 
 
 
419 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  25.2 
 
 
406 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2370  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.77 
 
 
313 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1581  S6 modification enzyme RimK  28.95 
 
 
313 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.683283  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.27 
 
 
410 aa  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2282  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.95 
 
 
313 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  27.17 
 
 
424 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.34 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.81 
 
 
403 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  28.84 
 
 
441 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  26.27 
 
 
373 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.01 
 
 
330 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  26.22 
 
 
413 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  27.17 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  27.95 
 
 
330 aa  47  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  30.07 
 
 
402 aa  46.6  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6598  phosphoribosylamine/glycine ligase  26.45 
 
 
423 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  29.57 
 
 
413 aa  46.6  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  24.29 
 
 
417 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  29.66 
 
 
432 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3204  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.55 
 
 
1042 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610402  normal  0.762296 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.2 
 
 
320 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4057  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.05 
 
 
1113 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3357  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.44 
 
 
1112 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  21.65 
 
 
322 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  23.87 
 
 
411 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1400  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.44 
 
 
420 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  21.99 
 
 
389 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>