22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5502 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6788  Flp/Fap pilin component  100 
 
 
68 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.234531 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5502  Flp/Fap pilin component  100 
 
 
68 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253434  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6376  Flp/Fap pilin component  98.53 
 
 
68 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.465787 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7205  Flp/Fap pilin component  79.41 
 
 
68 aa  84.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0699567  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6288  Flp/Fap pilin component  77.78 
 
 
68 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0180675  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5992  Flp/Fap pilin component  62.96 
 
 
68 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.651462  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0595  Flp/Fap pilin component  58 
 
 
56 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.311439  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  36.67 
 
 
60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  35.38 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  35.59 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  35 
 
 
60 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2021  Flp/Fap pilin component  34.33 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0651  Flp/Fap pilin component  48.84 
 
 
57 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2700  Flp/Fap pilin component  38.46 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2405  Flp/Fap pilin component  40.91 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.842762  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2545  Flp/Fap pilin component  42.31 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.221854  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3825  Flp/Fap pilin component  33.96 
 
 
55 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2477  Flp/Fap pilin component  30.36 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  35.85 
 
 
57 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0788  Flp/Fap pilin component  40 
 
 
72 aa  40.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2640  Flp/Fap pilin component  40.98 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  34.62 
 
 
52 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>