264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5491 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  100 
 
 
325 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  99.08 
 
 
325 aa  645    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  99.69 
 
 
325 aa  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  90.46 
 
 
325 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  78.48 
 
 
325 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  77.85 
 
 
325 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  70.12 
 
 
325 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  70.12 
 
 
325 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  70.12 
 
 
325 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  67.69 
 
 
325 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  58.77 
 
 
325 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  58.31 
 
 
325 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  56 
 
 
325 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  57.32 
 
 
325 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  56.75 
 
 
326 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  50.15 
 
 
325 aa  323  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  49.39 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  45.54 
 
 
325 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  48.43 
 
 
330 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  44.62 
 
 
325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  44.31 
 
 
322 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  39.87 
 
 
321 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  39.38 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  46.69 
 
 
321 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  37.91 
 
 
321 aa  205  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  35.62 
 
 
323 aa  200  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  35.97 
 
 
325 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  35.95 
 
 
332 aa  188  9e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  37.8 
 
 
320 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  36.12 
 
 
322 aa  179  8e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  35.67 
 
 
322 aa  179  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  44.28 
 
 
322 aa  177  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  35.58 
 
 
320 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  33.33 
 
 
320 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  36.67 
 
 
321 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  39.6 
 
 
323 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  31.42 
 
 
321 aa  153  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  39.06 
 
 
328 aa  149  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  31.85 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  32.71 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  32.17 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  31.15 
 
 
316 aa  145  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  33.54 
 
 
314 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  31.08 
 
 
322 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  30.37 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  29.45 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  34.08 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  30.03 
 
 
322 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  34.69 
 
 
282 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  30.85 
 
 
335 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  29.21 
 
 
322 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  39.8 
 
 
332 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  33.33 
 
 
324 aa  135  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  29.28 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  39.02 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  29.28 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  30.14 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  38.74 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  36.18 
 
 
336 aa  133  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  34.62 
 
 
660 aa  133  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  28.09 
 
 
337 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  31.33 
 
 
323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  36.68 
 
 
327 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2020  type II secretion system protein  32.08 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243296  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  30.08 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  36.18 
 
 
327 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  31.16 
 
 
323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  35.29 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  35.48 
 
 
325 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  32.62 
 
 
315 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  32.26 
 
 
323 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  32.79 
 
 
310 aa  123  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  30.55 
 
 
337 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  37.89 
 
 
313 aa  122  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  30.17 
 
 
324 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  36.52 
 
 
325 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  36.52 
 
 
325 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  32.26 
 
 
290 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  27.69 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  33.47 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  36.36 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  26.32 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  32.22 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  36.47 
 
 
330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  36.81 
 
 
310 aa  119  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  33.98 
 
 
335 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  36.52 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  36.47 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  36.47 
 
 
331 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  36.47 
 
 
331 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  36.07 
 
 
275 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  36.47 
 
 
331 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  36.47 
 
 
331 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  36.47 
 
 
331 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  32.84 
 
 
325 aa  116  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  29.6 
 
 
324 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  30.42 
 
 
324 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  30 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  34.55 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  35.06 
 
 
317 aa  113  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0435404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>