More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5485 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  97.35 
 
 		 415 aa  824    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  74.63 
 
 		 433 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  90.36 
 
 		 415 aa  771    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  75.37 
 
 		 409 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 415 aa  845    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  92.4 
 
 		 409 aa  769    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 415 aa  845    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  92.89 
 
 		 409 aa  773    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  70.72 
 
 		 411 aa  586  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  65.61 
 
 		 420 aa  554  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  62.77 
 
 		 410 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  62.5 
 
 		 413 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  62.25 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  59.95 
 
 		 407 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  59.95 
 
 		 407 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  56.62 
 
 		 408 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2716  hypothetical protein  75.43 
 
 		 181 aa  292  7e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  54.94 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0110  hypothetical protein  59.88 
 
 		 193 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05376  conserved hypothetical protein  45.34 
 
 		 412 aa  209  6e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.964155  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1391  hypothetical protein  56.49 
 
 		 178 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  45.96 
 
 		 231 aa  193  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1605  hypothetical protein  55.84 
 
 		 179 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  45.49 
 
 		 235 aa  186  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  42.36 
 
 		 250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07139  dienelactone hydrolase (AFU_orthologue; AFUA_4G03730)  43.52 
 
 		 499 aa  178  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.167964 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  47.09 
 
 		 233 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  42.73 
 
 		 236 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  43.59 
 
 		 236 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  41.89 
 
 		 232 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  41.78 
 
 		 230 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  40.89 
 
 		 230 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  45.37 
 
 		 237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  41.33 
 
 		 230 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  41.33 
 
 		 230 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  40.76 
 
 		 232 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  40.44 
 
 		 230 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  41.33 
 
 		 230 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  42.79 
 
 		 232 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  44.44 
 
 		 230 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  44.44 
 
 		 230 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  44.44 
 
 		 230 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  44.44 
 
 		 230 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  44.44 
 
 		 230 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  44.44 
 
 		 230 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  44.44 
 
 		 230 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  42.15 
 
 		 248 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  43.11 
 
 		 230 aa  152  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  40.44 
 
 		 230 aa  150  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  39.57 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  40.34 
 
 		 232 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  38.53 
 
 		 232 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  42.47 
 
 		 235 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  39.57 
 
 		 222 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  35.29 
 
 		 236 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  32.58 
 
 		 234 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  39.9 
 
 		 234 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07470  dienelactone hydrolase (AFU_orthologue; AFUA_2G05810)  35.81 
 
 		 430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.507136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  39.52 
 
 		 234 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  35 
 
 		 246 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  35.83 
 
 		 240 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 		 229 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  32.33 
 
 		 295 aa  111  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  33.19 
 
 		 295 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  33.19 
 
 		 295 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  32.76 
 
 		 254 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  33.48 
 
 		 295 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  34.35 
 
 		 223 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  39.49 
 
 		 230 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  34.67 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  33.63 
 
 		 223 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  33.03 
 
 		 251 aa  106  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  35.9 
 
 		 229 aa  106  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  32.91 
 
 		 227 aa  106  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  34.65 
 
 		 221 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  35.29 
 
 		 232 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  31.49 
 
 		 296 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  32.05 
 
 		 229 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  32.89 
 
 		 248 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 230 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  29.88 
 
 		 251 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  34.38 
 
 		 297 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  35.04 
 
 		 229 aa  99.8  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  32.06 
 
 		 247 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  33.92 
 
 		 229 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  33.92 
 
 		 229 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  31.78 
 
 		 303 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  33.91 
 
 		 220 aa  97.8  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  31.2 
 
 		 229 aa  97.4  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  30.13 
 
 		 248 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  31.98 
 
 		 295 aa  96.7  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  31.84 
 
 		 247 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  30.17 
 
 		 295 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  33.02 
 
 		 247 aa  96.3  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  31.76 
 
 		 295 aa  96.3  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  32.47 
 
 		 299 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  30.51 
 
 		 298 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  37.67 
 
 		 244 aa  94  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  32.56 
 
 		 245 aa  94  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>