More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5436 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  100 
 
 
268 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  99.63 
 
 
268 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  99.63 
 
 
268 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  95.15 
 
 
268 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  95.9 
 
 
268 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  95.15 
 
 
268 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  92.91 
 
 
268 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  84.07 
 
 
269 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  84.07 
 
 
269 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  86.67 
 
 
266 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1802  D-methionine-binding lipoprotein metQ  86.27 
 
 
259 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0371  YaeC family lipoprotein  86.67 
 
 
259 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0468  YaeC family lipoprotein  86.67 
 
 
259 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  86.27 
 
 
297 aa  455  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  82.4 
 
 
268 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  71.64 
 
 
270 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  72.01 
 
 
270 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  74.09 
 
 
270 aa  391  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  76.95 
 
 
268 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  76.95 
 
 
268 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  76.54 
 
 
529 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  66.05 
 
 
271 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  68.42 
 
 
270 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  67.04 
 
 
271 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  67.04 
 
 
271 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  67.04 
 
 
271 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  65.93 
 
 
271 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  65.93 
 
 
271 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  65.93 
 
 
271 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  65.43 
 
 
271 aa  360  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  68.15 
 
 
281 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  68.55 
 
 
272 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  68.15 
 
 
272 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  68.15 
 
 
272 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  68.15 
 
 
272 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  68.15 
 
 
272 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  68.15 
 
 
272 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  68.15 
 
 
272 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  57.68 
 
 
266 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  59.04 
 
 
274 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  58.2 
 
 
264 aa  305  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  59.93 
 
 
266 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  59.93 
 
 
266 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  56.91 
 
 
272 aa  291  9e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  58.96 
 
 
265 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  55.74 
 
 
286 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  56.93 
 
 
264 aa  289  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  59.5 
 
 
262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  59.76 
 
 
264 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  61 
 
 
265 aa  285  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  58.7 
 
 
264 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  59.18 
 
 
264 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  59.18 
 
 
264 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  59.18 
 
 
264 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  54.31 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  61.92 
 
 
266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  59.76 
 
 
265 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  59.09 
 
 
264 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  59.58 
 
 
265 aa  278  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  59.17 
 
 
259 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0412  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  60.73 
 
 
259 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2868  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  58.43 
 
 
266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.257161  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  53.85 
 
 
258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  53.85 
 
 
258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  54.68 
 
 
266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  54.68 
 
 
266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  56.02 
 
 
258 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0217  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  60.32 
 
 
264 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2556  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  60.32 
 
 
264 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0932  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  60.32 
 
 
259 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2978  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  58.43 
 
 
266 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  54.09 
 
 
257 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  54.3 
 
 
258 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  53.1 
 
 
258 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1652  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  58.8 
 
 
266 aa  268  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  52.92 
 
 
257 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  52.99 
 
 
262 aa  267  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2929  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  60.67 
 
 
266 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  53.46 
 
 
258 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  51.71 
 
 
264 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  48.15 
 
 
259 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  53.36 
 
 
263 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3855  DL-methionine transporter subunit  50 
 
 
273 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  48.05 
 
 
259 aa  251  6e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  47.66 
 
 
259 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  53.75 
 
 
260 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4856  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  56.9 
 
 
260 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  52.72 
 
 
257 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0157  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  50.6 
 
 
274 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619051  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  53.88 
 
 
260 aa  248  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  51.59 
 
 
269 aa  247  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  47.78 
 
 
278 aa  246  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1102  D-methionine ABC transporter, periplasmic methionine-binding protein  49.22 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  47.41 
 
 
278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7228  outer membrane lipoprotein  50.2 
 
 
266 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  50.83 
 
 
267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.83 
 
 
267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  50.42 
 
 
278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  48.53 
 
 
271 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  48.53 
 
 
271 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>