More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5427 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5427  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 
276 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394038  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 
276 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 
276 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  94.93 
 
 
276 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  93.12 
 
 
273 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  91.67 
 
 
273 aa  497  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  79.79 
 
 
280 aa  431  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  68.84 
 
 
272 aa  348  7e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1830  hemin importer ATP-binding subunit  69.93 
 
 
272 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1775  hemin importer ATP-binding subunit  69.93 
 
 
272 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2096  hemin importer ATP-binding subunit  69.93 
 
 
272 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0341  hemin importer ATP-binding subunit  69.93 
 
 
272 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853045  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0830  hemin importer ATP-binding subunit  69.93 
 
 
272 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1121  hemin importer ATP-binding subunit  69.93 
 
 
272 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.402824  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0434  hemin importer ATP-binding subunit  69.57 
 
 
272 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  40.94 
 
 
258 aa  190  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  41.82 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  37.96 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  39.42 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  37.96 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  44.06 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  41.18 
 
 
265 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  39.86 
 
 
270 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  40.44 
 
 
268 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  40.23 
 
 
266 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  40.23 
 
 
266 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  40.23 
 
 
266 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  43.85 
 
 
255 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  42.91 
 
 
272 aa  166  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  44.53 
 
 
255 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  36.46 
 
 
254 aa  166  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  37.73 
 
 
254 aa  166  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  41.31 
 
 
262 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  43.85 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  43.64 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  39.61 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  43.85 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  39.57 
 
 
263 aa  161  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  43.13 
 
 
255 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  40.88 
 
 
253 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  41.47 
 
 
261 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  42.39 
 
 
255 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  41.13 
 
 
261 aa  158  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  40.07 
 
 
272 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  35.87 
 
 
264 aa  156  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  39.27 
 
 
288 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  39.78 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  40.86 
 
 
262 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  38.31 
 
 
264 aa  155  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  39.27 
 
 
288 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  37.23 
 
 
254 aa  155  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  38.04 
 
 
272 aa  155  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  37.27 
 
 
267 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  38.91 
 
 
288 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  38.18 
 
 
274 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  38.15 
 
 
260 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  37.63 
 
 
282 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  38.28 
 
 
259 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  37.09 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  32.48 
 
 
418 aa  152  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  39.16 
 
 
259 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  38.91 
 
 
290 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  40.84 
 
 
264 aa  151  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  40.91 
 
 
271 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  42.26 
 
 
255 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  37.45 
 
 
268 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  32.73 
 
 
268 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  43.13 
 
 
258 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  32.56 
 
 
405 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  34.87 
 
 
266 aa  149  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  38.97 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  38.1 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  38.1 
 
 
294 aa  146  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  36.78 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  34.85 
 
 
455 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1619  ABC transporter related  33.46 
 
 
279 aa  145  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  41.31 
 
 
268 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  37.26 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  36.06 
 
 
259 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  38.71 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  36.59 
 
 
272 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  39.26 
 
 
536 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  40.38 
 
 
267 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  37.84 
 
 
262 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  33.58 
 
 
273 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.58 
 
 
273 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.71 
 
 
263 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  37.7 
 
 
275 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  42.26 
 
 
257 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  30.91 
 
 
256 aa  143  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  39.62 
 
 
269 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  32.84 
 
 
251 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  37.45 
 
 
260 aa  142  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  40.36 
 
 
293 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  36.54 
 
 
265 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  37.04 
 
 
490 aa  142  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  31.5 
 
 
260 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  31.5 
 
 
260 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.21 
 
 
273 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  37.55 
 
 
260 aa  142  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>