185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5290 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  97.49 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  96.65 
 
 		 239 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  96.65 
 
 		 239 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  94.56 
 
 		 239 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  94.56 
 
 		 239 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  84.94 
 
 		 243 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  84.94 
 
 		 243 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  84.94 
 
 		 243 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  83.55 
 
 		 239 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  82.33 
 
 		 239 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  81.58 
 
 		 239 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  78.85 
 
 		 239 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  74.45 
 
 		 238 aa  350  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  72.22 
 
 		 238 aa  348  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.64 
 
 		 247 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  71.17 
 
 		 245 aa  325  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.81 
 
 		 240 aa  322  3e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  69.33 
 
 		 250 aa  317  7e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  69.47 
 
 		 246 aa  316  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  67.86 
 
 		 232 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.96 
 
 		 340 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  67.41 
 
 		 232 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  66.52 
 
 		 244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  67.86 
 
 		 232 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.96 
 
 		 242 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  68.42 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  63.72 
 
 		 239 aa  303  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  63.09 
 
 		 255 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  67.53 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 340 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  63.2 
 
 		 255 aa  299  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  65.49 
 
 		 254 aa  298  4e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.7 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.7 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  60.89 
 
 		 439 aa  287  9e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.56 
 
 		 236 aa  286  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  63.6 
 
 		 274 aa  285  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.77 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 240 aa  278  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 268 aa  278  4e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  62.23 
 
 		 263 aa  278  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.52 
 
 		 267 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.08 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  56.44 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 244 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.29 
 
 		 255 aa  245  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  53.91 
 
 		 255 aa  243  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.74 
 
 		 243 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  49.17 
 
 		 344 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  49.17 
 
 		 269 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  49.17 
 
 		 312 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  49.17 
 
 		 269 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  49.17 
 
 		 269 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  49.17 
 
 		 269 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  49.17 
 
 		 269 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  48.76 
 
 		 269 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.37 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  47.37 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5538  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.49 
 
 		 338 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.13336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  45.09 
 
 		 245 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  47.37 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  44.78 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 231 aa  198  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  42.86 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4415  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2550  transcriptional regulator-related protein  40.09 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  43.36 
 
 		 247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  42.49 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 279 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1232  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  41.07 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0044  hypothetical protein  39.91 
 
 		 264 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.91 
 
 		 264 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2890  hypothetical protein  39.91 
 
 		 264 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2195  hypothetical protein  39.91 
 
 		 264 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0643  hypothetical protein  39.91 
 
 		 264 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0657  hypothetical protein  39.91 
 
 		 264 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2512  hypothetical protein  39.91 
 
 		 264 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315481  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1356  hypothetical protein  39.82 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.073199  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5994  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.03 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1537  hypothetical protein  39.38 
 
 		 236 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0178  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.48 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2421  Crp/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4390  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1803  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.18 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3744  cyclic nucleotide-binding protein  37.18 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4112  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>