95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5267 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  43.9 
 
 
2888 aa  2309    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  40.16 
 
 
2860 aa  1957    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  55.06 
 
 
2761 aa  2715    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  36.98 
 
 
2823 aa  1919    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  56.78 
 
 
2842 aa  3043    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  45.26 
 
 
3021 aa  1298    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  43.24 
 
 
2833 aa  2237    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  44.52 
 
 
2864 aa  2333    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  44.86 
 
 
2864 aa  2189    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  44.5 
 
 
1303 aa  1063    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  44.31 
 
 
2870 aa  2237    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  47.3 
 
 
2916 aa  1396    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  50.46 
 
 
2748 aa  1440    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  44.15 
 
 
2864 aa  2184    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  92.34 
 
 
2875 aa  5177    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  42.29 
 
 
2730 aa  1080    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  41.83 
 
 
2880 aa  2051    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  92.83 
 
 
2874 aa  5100    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  39.18 
 
 
2453 aa  1341    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  42.93 
 
 
2839 aa  2204    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  37.66 
 
 
2887 aa  2107    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  44.36 
 
 
2881 aa  2074    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  70.42 
 
 
2901 aa  3911    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  42.43 
 
 
2929 aa  2073    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  44.87 
 
 
2732 aa  2269    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  42.96 
 
 
2932 aa  2056    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  43.72 
 
 
2859 aa  2053    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  53.96 
 
 
2769 aa  2734    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  42.68 
 
 
2905 aa  2106    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  52.76 
 
 
2748 aa  1446    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  43.49 
 
 
2786 aa  1324    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  42.8 
 
 
2839 aa  2193    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  40.37 
 
 
2793 aa  1774    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  39.25 
 
 
2922 aa  2088    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  57.64 
 
 
2868 aa  3088    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  57.12 
 
 
2845 aa  3067    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  100 
 
 
2868 aa  5720    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  53.03 
 
 
2758 aa  1465    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  40.75 
 
 
2716 aa  1071    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  99.89 
 
 
2831 aa  5638    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  42.58 
 
 
2779 aa  1946    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  42.75 
 
 
2731 aa  1107    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  40.34 
 
 
2884 aa  2158    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  51.87 
 
 
2747 aa  1476    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  53.09 
 
 
624 aa  635  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  34.37 
 
 
786 aa  496  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  37.74 
 
 
849 aa  491  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  29.31 
 
 
790 aa  337  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  31.27 
 
 
785 aa  330  3e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  29.49 
 
 
801 aa  327  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  28.71 
 
 
802 aa  325  5e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  28.55 
 
 
822 aa  325  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  27.76 
 
 
784 aa  324  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  28.35 
 
 
802 aa  323  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  29.06 
 
 
784 aa  321  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  29.46 
 
 
815 aa  320  4e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  27.95 
 
 
813 aa  317  1.9999999999999998e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  27.95 
 
 
813 aa  317  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  27.51 
 
 
811 aa  308  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  28.79 
 
 
815 aa  298  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  27.19 
 
 
819 aa  298  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  27.07 
 
 
811 aa  293  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  29.29 
 
 
822 aa  290  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  28.07 
 
 
811 aa  290  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  26.86 
 
 
811 aa  286  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  28.91 
 
 
829 aa  281  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  27.47 
 
 
762 aa  281  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  26.37 
 
 
797 aa  279  5e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  27.54 
 
 
811 aa  279  6e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  27.11 
 
 
796 aa  276  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  26.1 
 
 
831 aa  276  6e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  29.32 
 
 
827 aa  271  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  26.32 
 
 
797 aa  267  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  29.15 
 
 
794 aa  263  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  27.38 
 
 
809 aa  263  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  29.16 
 
 
823 aa  263  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  27.62 
 
 
797 aa  261  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  26.22 
 
 
824 aa  251  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  26.57 
 
 
788 aa  202  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  28.94 
 
 
801 aa  202  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  24.03 
 
 
802 aa  147  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  21.92 
 
 
984 aa  106  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  24.8 
 
 
1094 aa  78.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  25 
 
 
1100 aa  75.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  27.57 
 
 
536 aa  70.5  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  26.03 
 
 
1136 aa  69.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  24.52 
 
 
1145 aa  61.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  35.34 
 
 
536 aa  61.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  38.05 
 
 
754 aa  59.7  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  27.76 
 
 
1076 aa  57  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  23.38 
 
 
900 aa  56.6  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  31.88 
 
 
541 aa  55.5  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1412  glucosyltransferase MdoH  31.8 
 
 
624 aa  50.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4220  hypothetical protein  23.24 
 
 
1169 aa  49.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1872  hypothetical protein  27.41 
 
 
461 aa  48.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>