288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5258 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 
159 aa  328  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
159 aa  328  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  98.74 
 
 
159 aa  326  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  90.57 
 
 
159 aa  307  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  86.16 
 
 
159 aa  297  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  85.53 
 
 
159 aa  291  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  83.02 
 
 
159 aa  284  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  79.87 
 
 
159 aa  278  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  73.42 
 
 
159 aa  258  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  72.33 
 
 
159 aa  258  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  72.96 
 
 
159 aa  255  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  72.15 
 
 
159 aa  254  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  74.68 
 
 
159 aa  249  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  74.68 
 
 
159 aa  249  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  69.81 
 
 
159 aa  235  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  62.03 
 
 
159 aa  213  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
159 aa  172  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  52.38 
 
 
162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.68 
 
 
153 aa  164  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.05 
 
 
163 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.63 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.95 
 
 
163 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
157 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.35 
 
 
152 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.97 
 
 
146 aa  148  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  46.21 
 
 
145 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  49.66 
 
 
145 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  60.71 
 
 
151 aa  146  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.69 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.97 
 
 
145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.9 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  50 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  46.26 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.9 
 
 
145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  44.14 
 
 
145 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.92 
 
 
145 aa  144  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.63 
 
 
157 aa  144  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  60.71 
 
 
151 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.21 
 
 
145 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  47.55 
 
 
159 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.21 
 
 
145 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  47.22 
 
 
145 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.59 
 
 
155 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.53 
 
 
145 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  46.53 
 
 
145 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.21 
 
 
145 aa  141  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  48.99 
 
 
154 aa  140  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  46.53 
 
 
145 aa  140  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  44.14 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.14 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.52 
 
 
145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  45.83 
 
 
145 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  46.53 
 
 
157 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  45.14 
 
 
145 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  44.37 
 
 
158 aa  135  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  46.53 
 
 
157 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.54 
 
 
150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.44 
 
 
146 aa  134  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  45.14 
 
 
145 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  49.3 
 
 
158 aa  134  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.96 
 
 
153 aa  133  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 
153 aa  133  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.85 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  43.75 
 
 
145 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  40.71 
 
 
147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.55 
 
 
153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  41.78 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  38.57 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  39.29 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.29 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  45.26 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  41.26 
 
 
150 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.25 
 
 
152 aa  124  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  42.07 
 
 
146 aa  124  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  46.48 
 
 
157 aa  124  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2658  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.72 
 
 
151 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764156  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.13 
 
 
155 aa  121  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.88 
 
 
146 aa  121  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  45.32 
 
 
167 aa  120  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.82 
 
 
146 aa  120  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  43.57 
 
 
157 aa  120  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
151 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
151 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  46.62 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  38.62 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  45 
 
 
156 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  45.95 
 
 
149 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  44.59 
 
 
149 aa  117  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  45.95 
 
 
149 aa  117  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  42.66 
 
 
152 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  39.01 
 
 
143 aa  117  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  41.84 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.31 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.62 
 
 
151 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  40.71 
 
 
157 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  45.95 
 
 
149 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1070  alkylhydroperoxidase  43.71 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>