More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5024 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5836  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
329 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5024  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
329 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205227  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4343  LysR family transcriptional regulator  99.09 
 
 
327 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3043  LysR family transcriptional regulator  82.07 
 
 
327 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.696334  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1196  LysR family transcriptional regulator  62.19 
 
 
323 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191376  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1489  LysR family transcriptional regulator  62.19 
 
 
323 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1404  LysR family transcriptional regulator  62.19 
 
 
323 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1394  LysR family transcriptional regulator  63.87 
 
 
430 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1142  LysR family transcriptional regulator  62.19 
 
 
323 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0157  LysR family transcriptional regulator  62.19 
 
 
323 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820068  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0435  LysR family transcriptional regulator  62.19 
 
 
323 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0008  transcriptional regulator  62.19 
 
 
431 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636727  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3828  LysR family transcriptional regulator  61.18 
 
 
322 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224143  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5764  LysR family transcriptional regulator  60.87 
 
 
322 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1305  LysR family transcriptional regulator  60.56 
 
 
322 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4540  LysR family transcriptional regulator  60.87 
 
 
322 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29008  normal  0.0118827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4426  LysR family transcriptional regulator  60.56 
 
 
322 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3964  LysR family transcriptional regulator  60.87 
 
 
322 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0669221  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4120  LysR family transcriptional regulator  60.06 
 
 
323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  53.25 
 
 
313 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  51.95 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  51.95 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  51.95 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  50.16 
 
 
312 aa  322  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  51.79 
 
 
313 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  51.95 
 
 
313 aa  322  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  51.79 
 
 
313 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1112  LysR family transcriptional regulator  51.92 
 
 
336 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358465  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1839  LysR family transcriptional regulator  51.92 
 
 
336 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0596  LysR family transcriptional regulator  51.92 
 
 
336 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2329  LysR family transcriptional regulator  51.92 
 
 
354 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1646  LysR family transcriptional regulator  51.92 
 
 
354 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0872  LysR family transcriptional regulator  51.92 
 
 
336 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  50.16 
 
 
312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1025  LysR family transcriptional regulator  51.28 
 
 
336 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  50.48 
 
 
312 aa  315  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  50.32 
 
 
313 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  50.32 
 
 
313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  50.32 
 
 
313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  50.32 
 
 
313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  50.32 
 
 
313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  50.32 
 
 
313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  50.32 
 
 
313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  50.32 
 
 
313 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1262  LysR family transcriptional regulator  50.99 
 
 
315 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.902208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4461  LysR family transcriptional regulator  50.99 
 
 
315 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4584  LysR family transcriptional regulator  50.99 
 
 
315 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143082  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0865  LysR family transcriptional regulator  50.33 
 
 
315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1210  putative transcriptional regulator  49.84 
 
 
317 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4325  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 
315 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4041  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 
315 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13510  LysR family transcriptional regulator  48.73 
 
 
317 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3196  LysR family transcriptional regulator  49.68 
 
 
315 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4797  transcriptional regulator, LysR family  49.04 
 
 
331 aa  298  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0282773  hitchhiker  0.00000720419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3740  LysR family transcriptional regulator  48.71 
 
 
315 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1681  LysR family transcriptional regulator  49.03 
 
 
315 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446962  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1864  LysR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
331 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708451  normal  0.0358907 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4285  LysR family transcriptional regulator  48.06 
 
 
315 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.300927 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4214  LysR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
315 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.383155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  49.03 
 
 
323 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1216  transcriptional regulator, LysR family  50.17 
 
 
315 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6200  LysR family transcriptional regulator  51.43 
 
 
316 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503075 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5833  LysR family transcriptional regulator  51.43 
 
 
316 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  49.35 
 
 
318 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6676  LysR family transcriptional regulator  51.11 
 
 
316 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454387  normal  0.341133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1044  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  49.83 
 
 
332 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.865685  normal  0.351691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2420  LysR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
334 aa  288  9e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0259227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0937  LysR family transcriptional regulator  48 
 
 
322 aa  285  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5752  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 
313 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.515576 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5996  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 
313 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.48899 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5074  LysR family transcriptional regulator  47.26 
 
 
332 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119711  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52930  transcriptional regulator  47.88 
 
 
314 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30988  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4638  transcriptional regulator  47.56 
 
 
314 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6527  LysR family transcriptional regulator  49.68 
 
 
313 aa  281  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2804  LysR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
308 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3585  LysR family transcriptional regulator  47.23 
 
 
312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364205  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5327  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 
317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0620404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0237  putative transcriptional regulator  45.63 
 
 
355 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01980  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 
312 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.445097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  44.69 
 
 
311 aa  248  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2435  LysR family transcriptional regulator  43.83 
 
 
310 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6627  LysR family transcriptional regulator  45.3 
 
 
308 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.184966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2931  LysR family transcriptional regulator  43.89 
 
 
352 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2866  LysR family transcriptional regulator  45.72 
 
 
310 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3493  LysR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.911238  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2278  LysR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4290  LysR family transcriptional regulator  43.57 
 
 
328 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3189  LysR family transcriptional regulator  43.57 
 
 
328 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4971  LysR family transcriptional regulator  43.57 
 
 
328 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2317  LysR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
315 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27400  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
323 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1894  LysR family transcriptional regulator  43.23 
 
 
324 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5702  LysR family transcriptional regulator  42 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0313513 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  43.84 
 
 
305 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2962  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
320 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4633  LysR family transcriptional regulator  39.14 
 
 
322 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal  0.676677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4278  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
312 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2877  LysR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
320 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3014  LysR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
320 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6316  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 
320 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>