259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4905 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  66.06 
 
 		 542 aa  711    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 599 aa  1205    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 599 aa  1205    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  52.04 
 
 		 536 aa  551  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  41.3 
 
 		 551 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  39.1 
 
 		 556 aa  330  4e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  39.1 
 
 		 556 aa  330  4e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  39.1 
 
 		 556 aa  330  4e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  39.1 
 
 		 556 aa  330  4e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  42.18 
 
 		 548 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  38.87 
 
 		 547 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  39.91 
 
 		 560 aa  281  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  42.25 
 
 		 509 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  42.25 
 
 		 572 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  42.25 
 
 		 562 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  37.35 
 
 		 541 aa  276  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  37.35 
 
 		 541 aa  276  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  37.35 
 
 		 541 aa  276  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  37.35 
 
 		 541 aa  276  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  33.07 
 
 		 625 aa  273  6e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  34.43 
 
 		 630 aa  271  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  33.27 
 
 		 611 aa  263  8e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  33.8 
 
 		 636 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  36.6 
 
 		 554 aa  261  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  30.94 
 
 		 626 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  36.82 
 
 		 552 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  35.81 
 
 		 547 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  33.65 
 
 		 614 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  34.69 
 
 		 640 aa  238  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  28.96 
 
 		 618 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  38.92 
 
 		 422 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  33.91 
 
 		 640 aa  229  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  41.99 
 
 		 382 aa  226  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  34.34 
 
 		 632 aa  223  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  33.82 
 
 		 640 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  33.82 
 
 		 640 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  28.6 
 
 		 616 aa  217  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  30.06 
 
 		 595 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  25.32 
 
 		 618 aa  213  9e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  25.32 
 
 		 618 aa  213  9e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  33.06 
 
 		 550 aa  211  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  38.93 
 
 		 497 aa  196  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  35.44 
 
 		 560 aa  196  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6246  hypothetical protein  56.25 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  33.7 
 
 		 649 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  29.41 
 
 		 677 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  29.41 
 
 		 652 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  29.41 
 
 		 652 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 652 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  25.32 
 
 		 558 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  25.29 
 
 		 558 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  26.59 
 
 		 555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2133  hypothetical protein  33.06 
 
 		 291 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992239  normal  0.0302754 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  26.79 
 
 		 567 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  28.93 
 
 		 560 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  27.99 
 
 		 561 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  28.37 
 
 		 663 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  28.21 
 
 		 902 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  29.23 
 
 		 617 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  30.98 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  25.05 
 
 		 636 aa  112  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  28.52 
 
 		 617 aa  112  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  29.19 
 
 		 322 aa  111  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  27.13 
 
 		 670 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  29.14 
 
 		 481 aa  108  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  24.83 
 
 		 721 aa  107  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  25.88 
 
 		 581 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  28.26 
 
 		 810 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  28.83 
 
 		 900 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  28.42 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  28.83 
 
 		 900 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4687  integrase, catalytic region  38.29 
 
 		 168 aa  104  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.887528  normal  0.0224693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  27.74 
 
 		 774 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  27.74 
 
 		 497 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  27.74 
 
 		 497 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  27.74 
 
 		 497 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  25.83 
 
 		 653 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  21 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  21 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  29.45 
 
 		 733 aa  100  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  26.52 
 
 		 614 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  26.52 
 
 		 614 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  26.52 
 
 		 614 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  28.37 
 
 		 902 aa  94.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  25.64 
 
 		 704 aa  90.9  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  30.04 
 
 		 782 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  23.68 
 
 		 644 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6966  hypothetical protein  27.51 
 
 		 728 aa  88.2  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4430  hypothetical protein  26.15 
 
 		 876 aa  85.1  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  26.02 
 
 		 905 aa  85.1  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  26.02 
 
 		 905 aa  85.1  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  26.02 
 
 		 905 aa  85.1  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  26.02 
 
 		 905 aa  85.1  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  26.02 
 
 		 905 aa  85.1  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  27.43 
 
 		 917 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1116  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  25.24 
 
 		 721 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1192  integrase, catalytic region  28.9 
 
 		 740 aa  80.9  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  24.73 
 
 		 677 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1202  Tn5468, transposase protein B  28.65 
 
 		 722 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  24.89 
 
 		 907 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>