93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4895 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  100 
 
 
184 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  100 
 
 
184 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  98.91 
 
 
184 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  97.28 
 
 
184 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  97.28 
 
 
184 aa  370  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  79.57 
 
 
186 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  76.88 
 
 
186 aa  294  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  77.17 
 
 
184 aa  294  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  60.82 
 
 
182 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  60.82 
 
 
182 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  47.19 
 
 
187 aa  178  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  45.45 
 
 
190 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  41.18 
 
 
206 aa  138  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  36.25 
 
 
202 aa  117  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  37.21 
 
 
189 aa  108  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  32.96 
 
 
179 aa  105  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  28.41 
 
 
181 aa  100  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  34.21 
 
 
202 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  36.67 
 
 
180 aa  100  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  27.75 
 
 
181 aa  96.3  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  34.21 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  38.79 
 
 
170 aa  94.7  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  32.97 
 
 
187 aa  94.4  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  34.9 
 
 
177 aa  94  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  38.17 
 
 
145 aa  89.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  32.03 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  35.59 
 
 
147 aa  86.3  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  34.42 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  35.1 
 
 
176 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  32.03 
 
 
189 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  34.75 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  36.55 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  36.94 
 
 
177 aa  79  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  46.74 
 
 
190 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  40.43 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  38.6 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  28.12 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  32.64 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  38.14 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  29.55 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  26.16 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  28.66 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  40.62 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  29.19 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  29.81 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  36.7 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  38.05 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  28.93 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  40.22 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  31.2 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  37.17 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  35.11 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  35.11 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  27.5 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  29.37 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  29.66 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  27.92 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  30.51 
 
 
200 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  26.97 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  36.71 
 
 
138 aa  53.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  28.07 
 
 
134 aa  48.9  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  34 
 
 
164 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  30.12 
 
 
169 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  25.51 
 
 
169 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1957  OsmC family protein  29.55 
 
 
201 aa  47.8  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.226046 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  28.92 
 
 
168 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  23.48 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  29.59 
 
 
138 aa  46.6  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  27.17 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  26.09 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  28.92 
 
 
169 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  28.92 
 
 
169 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1477  OsmC family protein  31.65 
 
 
137 aa  46.2  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  26.09 
 
 
168 aa  45.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  28.57 
 
 
167 aa  45.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  25.93 
 
 
176 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  25.93 
 
 
176 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  33.9 
 
 
188 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  25.93 
 
 
176 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0218  hypothetical protein  34.72 
 
 
74 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  29.35 
 
 
167 aa  44.3  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  25.51 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  29.69 
 
 
357 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  32.86 
 
 
410 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  32.86 
 
 
410 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  25.49 
 
 
145 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0206  OsmC family protein  34 
 
 
174 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.338673  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  24.53 
 
 
129 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0037  OsmC-like protein  35.06 
 
 
158 aa  42  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  29.27 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  26.72 
 
 
131 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3865  OsmC family protein  34 
 
 
175 aa  41.6  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.745195  normal  0.175914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>