41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4848 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  100 
 
 		 234 aa  480  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  100 
 
 		 234 aa  480  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4197  VirB8 family protein  97.44 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  0.861265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  75.56 
 
 		 252 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  73.89 
 
 		 248 aa  348  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  68.67 
 
 		 234 aa  324  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2652  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  67.97 
 
 		 234 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1759  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  71.36 
 
 		 239 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117754  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0866  VirB8 family protein  40.8 
 
 		 290 aa  149  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1681  type IV secretory pathway, VirB8 component  38.65 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  36.61 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  34.39 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  34.39 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  34.06 
 
 		 225 aa  108  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0036  cmgB8  33.79 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  34.17 
 
 		 202 aa  99.8  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  27.65 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  26.69 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  27.57 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  28.91 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  29.44 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  28.51 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  27.01 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  28.86 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  28.99 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0013  conjugal transfer protein TraG  28.57 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.734906 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  26.9 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  26.44 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  30.35 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  27.27 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  28.04 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0027  conjugal transfer protein  27.12 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7530  VirB8 family protein  28.18 
 
 		 283 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587381  normal  0.0751978 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  24.51 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0097  pilx8 protein  25.75 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0330769  normal  0.561395 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3526  type IV secretion system protein VirB8  25.76 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0113  TriG protein  23.21 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  27.86 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  25.12 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  28.99 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0176  hypothetical protein  25.37 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>