More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4689 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  49.48 
 
 		 729 aa  654    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  93.14 
 
 		 743 aa  1373    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  51.36 
 
 		 724 aa  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  47.53 
 
 		 729 aa  640    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  52.07 
 
 		 724 aa  685    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  49.48 
 
 		 710 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  90.17 
 
 		 751 aa  1343    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  99.06 
 
 		 743 aa  1491    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  48.43 
 
 		 712 aa  637    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  95.42 
 
 		 743 aa  1405    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  49.48 
 
 		 710 aa  658    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 743 aa  1501    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 743 aa  1501    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  93 
 
 		 743 aa  1358    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  47.88 
 
 		 704 aa  598  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  38.26 
 
 		 719 aa  449  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  35.43 
 
 		 705 aa  342  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1495  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.24 
 
 		 711 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.454643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2394  TonB-dependent siderophore receptor  32.47 
 
 		 729 aa  324  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  34.17 
 
 		 702 aa  310  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 702 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  32.26 
 
 		 698 aa  299  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 708 aa  279  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 738 aa  257  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 707 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  31.24 
 
 		 707 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  31.24 
 
 		 707 aa  254  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 728 aa  252  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  30.72 
 
 		 823 aa  250  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 774 aa  248  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  31.55 
 
 		 762 aa  247  6e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 706 aa  243  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  32.04 
 
 		 754 aa  243  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  30.63 
 
 		 777 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 768 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 727 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  29.66 
 
 		 744 aa  229  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 		 737 aa  228  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  30.89 
 
 		 737 aa  228  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 727 aa  228  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  29.85 
 
 		 753 aa  225  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  31.06 
 
 		 804 aa  225  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 772 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 772 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  30.92 
 
 		 804 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 708 aa  221  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 716 aa  220  7e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 750 aa  220  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 726 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 728 aa  219  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 742 aa  219  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 819 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 685 aa  218  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  28.75 
 
 		 805 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 727 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  29.75 
 
 		 801 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 715 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  28.2 
 
 		 761 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 718 aa  215  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 		 722 aa  214  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 742 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  30.01 
 
 		 746 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 802 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  29.97 
 
 		 804 aa  213  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 730 aa  213  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 		 801 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 804 aa  211  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  30.16 
 
 		 749 aa  210  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 		 729 aa  210  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 800 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 709 aa  208  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 808 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 		 729 aa  206  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 755 aa  205  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 		 714 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 710 aa  204  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 734 aa  204  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 757 aa  202  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 726 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  30.74 
 
 		 773 aa  201  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 753 aa  201  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 		 718 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 759 aa  197  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  30.68 
 
 		 700 aa  197  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  29.4 
 
 		 770 aa  197  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 		 731 aa  197  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 728 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 		 809 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 725 aa  196  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 715 aa  195  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 710 aa  195  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 712 aa  194  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  29.54 
 
 		 730 aa  193  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  27.79 
 
 		 771 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 709 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  27.35 
 
 		 763 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 768 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 712 aa  191  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 728 aa  190  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 772 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.191382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>