More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4385 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4385  porin  100 
 
 		 385 aa  761    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  99.74 
 
 		 385 aa  758    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  99.74 
 
 		 385 aa  758    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  79.56 
 
 		 523 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  79.69 
 
 		 385 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  75.44 
 
 		 394 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  79.69 
 
 		 385 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  79.43 
 
 		 385 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  76.1 
 
 		 430 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  76.1 
 
 		 384 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  76.1 
 
 		 430 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  75.82 
 
 		 384 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  75.82 
 
 		 384 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  75.82 
 
 		 411 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  75.82 
 
 		 384 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  75.34 
 
 		 386 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  65.05 
 
 		 386 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  64.8 
 
 		 386 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  64.8 
 
 		 386 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  64.8 
 
 		 386 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  64.8 
 
 		 386 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  67.18 
 
 		 386 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  63.52 
 
 		 386 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  65.85 
 
 		 388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  65.16 
 
 		 393 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  65.66 
 
 		 393 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  60 
 
 		 387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  61.04 
 
 		 386 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  58.38 
 
 		 390 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  60.84 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  61.66 
 
 		 386 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  60.36 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  61.92 
 
 		 386 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  61.92 
 
 		 386 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  60.66 
 
 		 386 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  56.96 
 
 		 390 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  56.71 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  57.6 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  58.06 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  58.06 
 
 		 390 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  58.06 
 
 		 390 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  58.6 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  56.23 
 
 		 430 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  55.73 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  55.73 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  55.73 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  55.98 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  55.98 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  55.73 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  57.62 
 
 		 376 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  51.29 
 
 		 376 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  51.29 
 
 		 376 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  51.03 
 
 		 376 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  49.74 
 
 		 389 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  47.5 
 
 		 389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  46.97 
 
 		 385 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  46.72 
 
 		 385 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  48.48 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  45.39 
 
 		 397 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  48.23 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  48.23 
 
 		 383 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  48.23 
 
 		 383 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  46.78 
 
 		 391 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  44.89 
 
 		 421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  44.89 
 
 		 421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  45.64 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  45.14 
 
 		 397 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  44.25 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  44.64 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  44.25 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  44.25 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  44.25 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  45.79 
 
 		 445 aa  279  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  44.25 
 
 		 399 aa  279  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  44.62 
 
 		 391 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  43.42 
 
 		 397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  42.17 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  44.53 
 
 		 436 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  44.19 
 
 		 436 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  44.19 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  44.19 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  44.19 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  44.19 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  44.19 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  43.94 
 
 		 386 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  45.38 
 
 		 389 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  45.5 
 
 		 402 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  44.09 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  43.6 
 
 		 400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  43.18 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  44.65 
 
 		 384 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  44.65 
 
 		 384 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  44.65 
 
 		 384 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  44.65 
 
 		 384 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  44.65 
 
 		 384 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  43.8 
 
 		 389 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  44.65 
 
 		 384 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  44.65 
 
 		 384 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  42.56 
 
 		 395 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  42.82 
 
 		 394 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>