31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4334 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4032  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0901552  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3492  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419106 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4334  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00217512  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3438  hypothetical protein  84.07 
 
 
422 aa  303  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0612769  normal  0.0766715 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3945  hypothetical protein  84.62 
 
 
184 aa  303  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449838  normal  0.583142 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4556  hypothetical protein  82.32 
 
 
183 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.57288 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2037  hypothetical protein  71.98 
 
 
176 aa  253  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2999  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase  70.65 
 
 
225 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.368519  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3125  hypothetical protein  70.65 
 
 
226 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110791  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1350  hypothetical protein  70.11 
 
 
185 aa  247  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.718285  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4706  hypothetical protein  46.49 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0060028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3629  hypothetical protein  46.49 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.991909 
 
 
-
 
NC_003296  RS00364  hypothetical protein  42.45 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0509235  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0039  hypothetical protein  47.06 
 
 
172 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3151  hypothetical protein  45 
 
 
136 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5010  hypothetical protein  45 
 
 
136 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.833711  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0060  hypothetical protein  44.44 
 
 
138 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0049  hypothetical protein  44.87 
 
 
138 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1476  hypothetical protein  44.87 
 
 
138 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0047  hypothetical protein  44.87 
 
 
138 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1192  hypothetical protein  44.87 
 
 
135 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0039  hypothetical protein  44.87 
 
 
138 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1546  hypothetical protein  44.87 
 
 
172 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5295  hypothetical protein  40.91 
 
 
136 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5739  hypothetical protein  41.67 
 
 
135 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5120  hypothetical protein  41.67 
 
 
135 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4484  hypothetical protein  41.67 
 
 
135 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3136  hypothetical protein  40.48 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4285  hypothetical protein  37.35 
 
 
151 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0614  hypothetical protein  40.3 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0867662 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4449  hypothetical protein  37.23 
 
 
149 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>