More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4124 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  89.01 
 
 
355 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  97.18 
 
 
355 aa  699    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3275  ABC transporter related  98.59 
 
 
355 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.197934 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  97.46 
 
 
355 aa  705    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  90.14 
 
 
355 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  100 
 
 
355 aa  722    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  97.18 
 
 
355 aa  700    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3664  ABC transporter related  97.46 
 
 
355 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  100 
 
 
355 aa  722    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  87.85 
 
 
355 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  87.85 
 
 
355 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  87.85 
 
 
355 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  87.85 
 
 
355 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  87.57 
 
 
355 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  87.57 
 
 
355 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1727  ABC transporter, ATP-binding protein  88.7 
 
 
355 aa  626  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3216  ABC transporter related  63.89 
 
 
361 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2869  ABC transporter related  63.61 
 
 
361 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0665765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2939  ABC transporter ATP-binding protein  64.8 
 
 
358 aa  441  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.878604  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3947  ABC transporter-related protein  61.69 
 
 
356 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.615077 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1260  ABC transporter, ATP-binding protein  60.85 
 
 
356 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1377  ABC transporter related  60.85 
 
 
356 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3147  ABC transporter ATP-binding protein  60.85 
 
 
356 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1308  ABC transporter related  56.73 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  48.73 
 
 
363 aa  277  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3161  hypothetical protein  44.17 
 
 
358 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260707  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  45.71 
 
 
347 aa  265  7e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.53 
 
 
363 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  44.14 
 
 
342 aa  260  3e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  42.57 
 
 
358 aa  259  4e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  45.2 
 
 
353 aa  259  7e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.23 
 
 
355 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0179  ABC transporter related  41.27 
 
 
388 aa  256  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  44.23 
 
 
347 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.61 
 
 
362 aa  255  7e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4534  ABC transporter related  44.64 
 
 
365 aa  255  9e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251009  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  44.2 
 
 
362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.89 
 
 
355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  43.06 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  44.19 
 
 
352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.89 
 
 
355 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.62 
 
 
355 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0809  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 
350 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  50.6 
 
 
372 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  50.2 
 
 
372 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0759  ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 
350 aa  249  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.850542  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.69 
 
 
393 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  44.76 
 
 
337 aa  248  8e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.41 
 
 
364 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  44.69 
 
 
336 aa  248  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  42.59 
 
 
363 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  43.12 
 
 
347 aa  247  2e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1646  ABC transporter related  44.16 
 
 
352 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  44.69 
 
 
336 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1009  ABC transporter related  44.08 
 
 
347 aa  245  8e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.000145276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.57 
 
 
357 aa  245  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.37 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  44.55 
 
 
350 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2917  ABC transporter-like protein  44.09 
 
 
351 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  42.28 
 
 
363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  46.01 
 
 
364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  41 
 
 
357 aa  242  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2631  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.91 
 
 
358 aa  242  6e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  41.9 
 
 
356 aa  242  7e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  39.94 
 
 
343 aa  242  7e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  46.77 
 
 
358 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  42.15 
 
 
360 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3469  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.41 
 
 
393 aa  242  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.647978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.11 
 
 
359 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  41.85 
 
 
360 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.85 
 
 
402 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  41.85 
 
 
360 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1865  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.67 
 
 
364 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.02 
 
 
354 aa  241  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  48.86 
 
 
368 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  47.89 
 
 
399 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 
366 aa  239  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4874  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.3 
 
 
360 aa  239  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.368971 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3338  ABC transporter related  41.93 
 
 
352 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.81 
 
 
341 aa  239  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  42.95 
 
 
353 aa  239  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.62 
 
 
355 aa  239  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  42.25 
 
 
369 aa  238  9e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  45.31 
 
 
367 aa  238  9e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0424  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.99 
 
 
368 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  40.81 
 
 
349 aa  238  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  44.12 
 
 
353 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  42.37 
 
 
364 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.54 
 
 
363 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  43.58 
 
 
355 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  45 
 
 
361 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  36.91 
 
 
354 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5537  ABC transporter related  46.1 
 
 
366 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  42.53 
 
 
355 aa  236  3e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  46.92 
 
 
356 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.03 
 
 
343 aa  236  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  41.23 
 
 
360 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  41.23 
 
 
360 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  39.61 
 
 
356 aa  236  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  40.41 
 
 
356 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>