More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4039 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3742  porin  91.58 
 
 
380 aa  698  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  96.84 
 
 
380 aa  741  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  100 
 
 
379 aa  761  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  91.58 
 
 
380 aa  697  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  88.95 
 
 
380 aa  691  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  85.79 
 
 
380 aa  670  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  99.74 
 
 
380 aa  739  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  76.1 
 
 
411 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  66.75 
 
 
384 aa  507  1e-142  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  66.49 
 
 
384 aa  506  1e-142  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  66.49 
 
 
384 aa  506  1e-142  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  66.49 
 
 
384 aa  506  1e-142  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  66.75 
 
 
384 aa  507  1e-142  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  65.97 
 
 
384 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  65.97 
 
 
384 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  61.92 
 
 
383 aa  465  1e-130  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  62.34 
 
 
383 aa  460  1e-128  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  60.51 
 
 
390 aa  461  1e-128  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  64.56 
 
 
383 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  63.43 
 
 
409 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  59.59 
 
 
391 aa  438  1e-122  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  54.04 
 
 
379 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  52.54 
 
 
379 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  3.37977e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  53.92 
 
 
383 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  52.54 
 
 
379 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  53.05 
 
 
383 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  52.54 
 
 
379 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  52.54 
 
 
379 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  52.28 
 
 
379 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  4.14234e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  51.64 
 
 
381 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  5.10275e-08  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  53.39 
 
 
374 aa  358  1e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  52.53 
 
 
380 aa  356  3e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  50.76 
 
 
379 aa  357  3e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  52.27 
 
 
380 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  9.49722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  51 
 
 
381 aa  349  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  49.37 
 
 
383 aa  344  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  49.62 
 
 
383 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  49.37 
 
 
384 aa  342  7e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  51.12 
 
 
381 aa  342  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  51.19 
 
 
379 aa  339  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  50.5 
 
 
381 aa  335  6e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  49.35 
 
 
375 aa  327  2e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  50 
 
 
375 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  48.84 
 
 
375 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  48.84 
 
 
375 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  50.13 
 
 
384 aa  322  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  47.5 
 
 
384 aa  318  8e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  47.5 
 
 
384 aa  318  8e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  47.5 
 
 
384 aa  318  8e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  47.5 
 
 
384 aa  318  8e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  47.5 
 
 
384 aa  318  8e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  47.5 
 
 
384 aa  318  8e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  47.5 
 
 
384 aa  318  8e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  47.25 
 
 
414 aa  315  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  46.87 
 
 
383 aa  315  9e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  49.46 
 
 
375 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  48.37 
 
 
392 aa  309  7e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  49.1 
 
 
377 aa  305  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  49.23 
 
 
377 aa  305  1e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  47.62 
 
 
391 aa  303  4e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  47.37 
 
 
409 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  47.37 
 
 
409 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  47.26 
 
 
387 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  44.16 
 
 
376 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  45.45 
 
 
394 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  48.59 
 
 
363 aa  292  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  44.08 
 
 
383 aa  292  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  45.91 
 
 
384 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  44.44 
 
 
381 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  44.83 
 
 
385 aa  289  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  45.91 
 
 
384 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  45.91 
 
 
384 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  45.91 
 
 
384 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  45.21 
 
 
394 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  44.53 
 
 
396 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  45.21 
 
 
394 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  45.21 
 
 
394 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  44.72 
 
 
394 aa  286  3e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  45.12 
 
 
384 aa  285  1e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  44.85 
 
 
384 aa  284  2e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  48.07 
 
 
362 aa  282  6e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  48.07 
 
 
362 aa  282  6e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  48.07 
 
 
362 aa  282  6e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  45.11 
 
 
385 aa  282  7e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  48.84 
 
 
361 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  43.88 
 
 
394 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  43.67 
 
 
386 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  44.17 
 
 
386 aa  279  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  7.30188e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  47.06 
 
 
374 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  47.06 
 
 
374 aa  279  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  44.85 
 
 
384 aa  279  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  44.58 
 
 
389 aa  278  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  45.71 
 
 
385 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  45.71 
 
 
385 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  47.57 
 
 
374 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  48.35 
 
 
372 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  48.35 
 
 
372 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  45.92 
 
 
383 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  45.92 
 
 
383 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  42.11 
 
 
386 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>