More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3724 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  313  8e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  313  8e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  99.35 
 
 		 155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  72.37 
 
 		 152 aa  233  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  71.05 
 
 		 152 aa  232  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  71.52 
 
 		 152 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  73.03 
 
 		 152 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  73.03 
 
 		 152 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  73.03 
 
 		 152 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  69.54 
 
 		 154 aa  229  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  69.54 
 
 		 152 aa  229  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  69.54 
 
 		 152 aa  229  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  69.54 
 
 		 152 aa  229  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  69.54 
 
 		 152 aa  228  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  68.18 
 
 		 177 aa  228  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  67.76 
 
 		 154 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  64.9 
 
 		 154 aa  216  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  62 
 
 		 155 aa  206  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  60 
 
 		 155 aa  205  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  61.33 
 
 		 155 aa  202  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 152 aa  191  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 154 aa  188  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 154 aa  186  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 154 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  47.33 
 
 		 154 aa  157  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  48.3 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  49.66 
 
 		 164 aa  147  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 163 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  48.99 
 
 		 164 aa  147  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  48.99 
 
 		 164 aa  147  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  48.32 
 
 		 164 aa  147  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  48.32 
 
 		 164 aa  147  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  47.62 
 
 		 167 aa  146  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  48.32 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  48.32 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  48.32 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  48.32 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  48.32 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  48.32 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  48.32 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  48.32 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  48.32 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  48.32 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  48.32 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  48.32 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  48.32 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  48.32 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  48.32 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  48.32 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  48.99 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  48.32 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  48.32 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  48.3 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  46.94 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  47.62 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  46.36 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 155 aa  144  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  47.37 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  47.02 
 
 		 153 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 153 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  46.94 
 
 		 168 aa  143  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  46.94 
 
 		 168 aa  143  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  46.94 
 
 		 168 aa  143  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  46.94 
 
 		 168 aa  143  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  46.94 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  46.94 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  46.94 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  46.94 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  46.94 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.42 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 174 aa  141  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  48.03 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  43.9 
 
 		 165 aa  140  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  48.03 
 
 		 163 aa  140  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  46.98 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  46.98 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  46.98 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 160 aa  140  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 157 aa  140  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>