130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3683 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3683  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4684  putative methyltransferase  100 
 
 
287 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0882703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5616  methyltransferase  98.95 
 
 
287 aa  564  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1136  protein of unknown function Mtu_121  90.24 
 
 
285 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4542  methyltransferase  88.93 
 
 
292 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.165839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4078  putative methyltransferase  87.94 
 
 
293 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4009  methyltransferase  81.85 
 
 
286 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0764257  normal  0.338849 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3751  methyltransferase  79.86 
 
 
286 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0904683  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4828  methyltransferase  79.86 
 
 
286 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6184  methyltransferase  75.79 
 
 
289 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0022  hypothetical protein  74.74 
 
 
286 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3713  methyltransferase  64.08 
 
 
285 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1213  protein of unknown function Mtu_121  68.71 
 
 
285 aa  348  7e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3549  putative methyltransferase  65.59 
 
 
285 aa  347  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0944  hypothetical protein  62.81 
 
 
286 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0354  MerR family transcriptional regulator  62.81 
 
 
286 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1091  MerR family transcriptional regulator  62.81 
 
 
286 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0738969  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0437  hypothetical protein  62.81 
 
 
286 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0209  hypothetical protein  62.81 
 
 
286 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1892  hypothetical protein  62.81 
 
 
286 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1396  hypothetical protein  62.81 
 
 
286 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2748  methyltransferase  66.2 
 
 
285 aa  341  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1806  hypothetical protein  62.46 
 
 
286 aa  341  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2654  methyltransferase  64.91 
 
 
285 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
630 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
604 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
630 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
604 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
604 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
604 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
659 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
648 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
639 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2212  putative methyltransferase  36.3 
 
 
285 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0483  methyltransferase  37.82 
 
 
292 aa  142  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00128266  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4307  hypothetical protein  36.5 
 
 
311 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2540  methyltransferase  40.19 
 
 
276 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266861  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2234  methyltransferase  38.46 
 
 
276 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0473874  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0827  putative methyltransferase  29.37 
 
 
284 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2941  hypothetical protein  28.37 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.324225  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1717  methyltransferase  35.86 
 
 
280 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.203121  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3264  hypothetical protein  29.35 
 
 
306 aa  118  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3004  hypothetical protein  29.35 
 
 
306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3250  hypothetical protein  27.99 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1707  hypothetical protein  27.27 
 
 
304 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.410667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3019  hypothetical protein  27.99 
 
 
306 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3252  hypothetical protein  27.99 
 
 
306 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000435878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3270  methyltransferase, putative, family  28.91 
 
 
304 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.716508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2007  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000735866  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0188  putative methyltransferase  33.79 
 
 
292 aa  109  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1545  putative methyltransferase  33.09 
 
 
297 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1131  methyltransferase  31.37 
 
 
304 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020137  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1696  hypothetical protein  31.61 
 
 
298 aa  89.4  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.152352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0123  hypothetical protein  30.14 
 
 
310 aa  87  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000106694  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3294  hypothetical protein  30.05 
 
 
306 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1105  methyltransferase  28.43 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0581586  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3289  hypothetical protein  29.61 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13821  hypothetical protein  38.79 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2741  hypothetical protein  25.93 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.321866  hitchhiker  0.000409678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4234  methyltransferase  36 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1045  hypothetical protein  38.71 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1061  putative methyltransferase  38.71 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5025  putative methyltransferase  38.16 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056649  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1073  putative methyltransferase  38.71 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3295  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3964  methyltransferase  28.91 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0986536  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1226  methyltransferase  27.22 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1344  putative methyltransferase  34.15 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514876  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11746  hypothetical protein  30 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.399672 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1821  putative methyltransferase  23.16 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135863  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1534  methyltransferase  26.32 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5023  putative methyltransferase  36.18 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.388  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0104  putative methyltransferase  41.88 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1071  putative methyltransferase  34.38 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3293  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1043  hypothetical protein  34.38 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1059  putative methyltransferase  34.38 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.769331  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0743  putative methyltransferase  37.12 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10740  hypothetical protein  38.64 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.508563 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13799  hypothetical protein  35.1 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.224674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4761  methyltransferase  34.08 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.991548  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1345  putative methyltransferase  34.62 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10845  hypothetical protein  30.39 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203136  hitchhiker  0.000000140012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2358  methyltransferase  33.33 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3841  methyltransferase  36.43 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2218  hypothetical protein  36.26 
 
 
351 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3327  methyltransferase  36.54 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10745  hypothetical protein  35.17 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.397623 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11925  hypothetical protein  31.77 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.728522  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13434  hypothetical protein  34.23 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3240  hypothetical protein  28.37 
 
 
150 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0088  hypothetical protein  38.46 
 
 
312 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0097  putative methyltransferase  38.46 
 
 
312 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0973562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10912  hypothetical protein  32.35 
 
 
325 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0078  putative methyltransferase  38.46 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809042  normal  0.434766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0089  hypothetical protein  30.26 
 
 
263 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1044  hypothetical protein  34.06 
 
 
297 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0098  putative methyltransferase  30.26 
 
 
263 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.154609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1060  putative methyltransferase  34.06 
 
 
297 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1346  putative methyltransferase  34.97 
 
 
310 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>